Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

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Length 503 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nrf1Q9WU00 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nrf1Q9WU00 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Nrf1Q9WU00 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Nrf1Q9WU00 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nrf1Q9WU00 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nrf1Q9WU00 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nrf1Q9WU00 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nrf1Q9WU00 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nrf1Q9WU00 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nrf1Q9WU00 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nrf1Q9WU00 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nrf1Q9WU00 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nrf1Q9WU00 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nrf1Q9WU00 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Nrf1Q9WU00 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nrf1Q9WU00 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Nrf1Q9WU00 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nrf1Q9WU00 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nrf1Q9WU00 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nrf1Q9WU00 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nrf1Q9WU00 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nrf1Q9WU00 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nrf1Q9WU00 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nrf1Q9WU00 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nrf1Q9WU00 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nrf1Q9WU00 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nrf1Q9WU00 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nrf1Q9WU00 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Nrf1Q9WU00 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nrf1Q9WU00 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Nrf1Q9WU00 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nrf1Q9WU00 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nrf1Q9WU00 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nrf1Q9WU00 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nrf1Q9WU00 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nrf1Q9WU00 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nrf1Q9WU00 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nrf1Q9WU00 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nrf1Q9WU00 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nrf1Q9WU00 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nrf1Q9WU00 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nrf1Q9WU00 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nrf1Q9WU00 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nrf1Q9WU00 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nrf1Q9WU00 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nrf1Q9WU00 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nrf1Q9WU00 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nrf1Q9WU00 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nrf1Q9WU00 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nrf1Q9WU00 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nrf1Q9WU00 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nrf1Q9WU00 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nrf1Q9WU00 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nrf1Q9WU00 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nrf1Q9WU00 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nrf1Q9WU00 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nrf1Q9WU00 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nrf1Q9WU00 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nrf1Q9WU00 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nrf1Q9WU00 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nrf1Q9WU00 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nrf1Q9WU00 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nrf1Q9WU00 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nrf1Q9WU00 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nrf1Q9WU00 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nrf1Q9WU00 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nrf1Q9WU00 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nrf1Q9WU00 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nrf1Q9WU00 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nrf1Q9WU00 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Nrf1Q9WU00 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nrf1Q9WU00 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nrf1Q9WU00 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nrf1Q9WU00 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nrf1Q9WU00 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nrf1Q9WU00 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nrf1Q9WU00 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nrf1Q9WU00 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nrf1Q9WU00 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nrf1Q9WU00 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nrf1Q9WU00 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nrf1Q9WU00 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nrf1Q9WU00 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nrf1Q9WU00 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nrf1Q9WU00 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nrf1Q9WU00 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nrf1Q9WU00 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nrf1Q9WU00 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nrf1Q9WU00 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nrf1Q9WU00 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nrf1Q9WU00 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nrf1Q9WU00 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nrf1Q9WU00 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nrf1Q9WU00 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nrf1Q9WU00 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nrf1Q9WU00 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nrf1Q9WU00 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nrf1Q9WU00 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nrf1Q9WU00 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms