Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TapbpQ9R233 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TapbpQ9R233 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TapbpQ9R233 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TapbpQ9R233 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TapbpQ9R233 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TapbpQ9R233 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TapbpQ9R233 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TapbpQ9R233 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TapbpQ9R233 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TapbpQ9R233 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TapbpQ9R233 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TapbpQ9R233 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TapbpQ9R233 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TapbpQ9R233 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TapbpQ9R233 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TapbpQ9R233 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TapbpQ9R233 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TapbpQ9R233 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TapbpQ9R233 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TapbpQ9R233 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TapbpQ9R233 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TapbpQ9R233 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TapbpQ9R233 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TapbpQ9R233 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TapbpQ9R233 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TapbpQ9R233 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TapbpQ9R233 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TapbpQ9R233 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TapbpQ9R233 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TapbpQ9R233 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TapbpQ9R233 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TapbpQ9R233 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TapbpQ9R233 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TapbpQ9R233 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TapbpQ9R233 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TapbpQ9R233 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TapbpQ9R233 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TapbpQ9R233 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TapbpQ9R233 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TapbpQ9R233 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TapbpQ9R233 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TapbpQ9R233 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TapbpQ9R233 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TapbpQ9R233 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TapbpQ9R233 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TapbpQ9R233 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TapbpQ9R233 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TapbpQ9R233 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TapbpQ9R233 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TapbpQ9R233 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TapbpQ9R233 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TapbpQ9R233 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TapbpQ9R233 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TapbpQ9R233 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TapbpQ9R233 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TapbpQ9R233 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TapbpQ9R233 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TapbpQ9R233 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TapbpQ9R233 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TapbpQ9R233 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TapbpQ9R233 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TapbpQ9R233 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TapbpQ9R233 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TapbpQ9R233 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TapbpQ9R233 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TapbpQ9R233 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TapbpQ9R233 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TapbpQ9R233 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TapbpQ9R233 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TapbpQ9R233 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TapbpQ9R233 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TapbpQ9R233 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TapbpQ9R233 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TapbpQ9R233 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TapbpQ9R233 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TapbpQ9R233 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TapbpQ9R233 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TapbpQ9R233 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TapbpQ9R233 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TapbpQ9R233 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TapbpQ9R233 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TapbpQ9R233 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TapbpQ9R233 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TapbpQ9R233 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TapbpQ9R233 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TapbpQ9R233 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TapbpQ9R233 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TapbpQ9R233 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TapbpQ9R233 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TapbpQ9R233 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TapbpQ9R233 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TapbpQ9R233 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TapbpQ9R233 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TapbpQ9R233 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TapbpQ9R233 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TapbpQ9R233 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TapbpQ9R233 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TapbpQ9R233 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TapbpQ9R233 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms