Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Lamc3Q9R0B6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Lamc3Q9R0B6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
Lamc3Q9R0B6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Lamc3Q9R0B6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
Lamc3Q9R0B6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
Lamc3Q9R0B6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.75
Lamc3Q9R0B6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Lamc3Q9R0B6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Lamc3Q9R0B6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Lamc3Q9R0B6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
Lamc3Q9R0B6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
Lamc3Q9R0B6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
Lamc3Q9R0B6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Lamc3Q9R0B6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
Lamc3Q9R0B6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Lamc3Q9R0B6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
Lamc3Q9R0B6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Lamc3Q9R0B6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC38.43■■■■□ 3.74
Lamc3Q9R0B6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Lamc3Q9R0B6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Lamc3Q9R0B6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Lamc3Q9R0B6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
Lamc3Q9R0B6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC38.42■■■■□ 3.74
Lamc3Q9R0B6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC38.41■■■■□ 3.74
Lamc3Q9R0B6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
Lamc3Q9R0B6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Lamc3Q9R0B6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Lamc3Q9R0B6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Lamc3Q9R0B6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC38.4■■■■□ 3.74
Lamc3Q9R0B6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
Lamc3Q9R0B6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Lamc3Q9R0B6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Lamc3Q9R0B6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Lamc3Q9R0B6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Lamc3Q9R0B6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Lamc3Q9R0B6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
Lamc3Q9R0B6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
Lamc3Q9R0B6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
Lamc3Q9R0B6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
Lamc3Q9R0B6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
Lamc3Q9R0B6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
Lamc3Q9R0B6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
Lamc3Q9R0B6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
Lamc3Q9R0B6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC38.35■■■■□ 3.73
Lamc3Q9R0B6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Lamc3Q9R0B6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
Lamc3Q9R0B6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Lamc3Q9R0B6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC38.34■■■■□ 3.73
Lamc3Q9R0B6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Lamc3Q9R0B6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
Lamc3Q9R0B6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
Lamc3Q9R0B6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Lamc3Q9R0B6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Lamc3Q9R0B6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Lamc3Q9R0B6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC38.31■■■■□ 3.72
Lamc3Q9R0B6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Lamc3Q9R0B6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Lamc3Q9R0B6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Lamc3Q9R0B6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
Lamc3Q9R0B6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
Lamc3Q9R0B6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC38.29■■■■□ 3.72
Lamc3Q9R0B6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
Lamc3Q9R0B6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
Lamc3Q9R0B6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Lamc3Q9R0B6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Lamc3Q9R0B6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Lamc3Q9R0B6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Lamc3Q9R0B6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
Lamc3Q9R0B6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.72
Lamc3Q9R0B6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC38.26■■■■□ 3.72
Lamc3Q9R0B6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC38.25■■■■□ 3.71
Lamc3Q9R0B6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC38.24■■■■□ 3.71
Lamc3Q9R0B6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Lamc3Q9R0B6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Lamc3Q9R0B6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Lamc3Q9R0B6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Lamc3Q9R0B6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
Lamc3Q9R0B6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Lamc3Q9R0B6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Lamc3Q9R0B6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Lamc3Q9R0B6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Lamc3Q9R0B6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Lamc3Q9R0B6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.18■■■■□ 3.7
Lamc3Q9R0B6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.18■■■■□ 3.7
Lamc3Q9R0B6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.18■■■■□ 3.7
Lamc3Q9R0B6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Lamc3Q9R0B6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Lamc3Q9R0B6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
Lamc3Q9R0B6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Lamc3Q9R0B6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Lamc3Q9R0B6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Lamc3Q9R0B6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
Lamc3Q9R0B6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
Lamc3Q9R0B6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Lamc3Q9R0B6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Lamc3Q9R0B6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Lamc3Q9R0B6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Lamc3Q9R0B6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.69
Lamc3Q9R0B6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms