Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nek3Q9R0A5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nek3Q9R0A5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nek3Q9R0A5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nek3Q9R0A5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nek3Q9R0A5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nek3Q9R0A5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nek3Q9R0A5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nek3Q9R0A5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nek3Q9R0A5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nek3Q9R0A5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nek3Q9R0A5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nek3Q9R0A5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nek3Q9R0A5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nek3Q9R0A5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nek3Q9R0A5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nek3Q9R0A5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nek3Q9R0A5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nek3Q9R0A5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nek3Q9R0A5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nek3Q9R0A5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nek3Q9R0A5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nek3Q9R0A5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Nek3Q9R0A5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nek3Q9R0A5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nek3Q9R0A5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nek3Q9R0A5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nek3Q9R0A5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nek3Q9R0A5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nek3Q9R0A5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nek3Q9R0A5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nek3Q9R0A5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nek3Q9R0A5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nek3Q9R0A5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nek3Q9R0A5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nek3Q9R0A5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nek3Q9R0A5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nek3Q9R0A5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nek3Q9R0A5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nek3Q9R0A5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nek3Q9R0A5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nek3Q9R0A5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nek3Q9R0A5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nek3Q9R0A5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nek3Q9R0A5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nek3Q9R0A5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nek3Q9R0A5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nek3Q9R0A5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nek3Q9R0A5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nek3Q9R0A5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nek3Q9R0A5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nek3Q9R0A5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Nek3Q9R0A5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nek3Q9R0A5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nek3Q9R0A5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nek3Q9R0A5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nek3Q9R0A5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nek3Q9R0A5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nek3Q9R0A5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nek3Q9R0A5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nek3Q9R0A5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nek3Q9R0A5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nek3Q9R0A5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nek3Q9R0A5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nek3Q9R0A5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nek3Q9R0A5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nek3Q9R0A5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nek3Q9R0A5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nek3Q9R0A5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nek3Q9R0A5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nek3Q9R0A5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nek3Q9R0A5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nek3Q9R0A5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nek3Q9R0A5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nek3Q9R0A5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nek3Q9R0A5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nek3Q9R0A5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nek3Q9R0A5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nek3Q9R0A5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nek3Q9R0A5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nek3Q9R0A5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nek3Q9R0A5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nek3Q9R0A5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nek3Q9R0A5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nek3Q9R0A5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nek3Q9R0A5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nek3Q9R0A5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Nek3Q9R0A5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nek3Q9R0A5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nek3Q9R0A5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nek3Q9R0A5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nek3Q9R0A5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nek3Q9R0A5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nek3Q9R0A5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nek3Q9R0A5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nek3Q9R0A5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nek3Q9R0A5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nek3Q9R0A5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nek3Q9R0A5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nek3Q9R0A5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.2 ms