Protein–RNA interactions for Protein: Q9R059

Fhl3, Four and a half LIM domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhl3Q9R059 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fhl3Q9R059 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fhl3Q9R059 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fhl3Q9R059 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fhl3Q9R059 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fhl3Q9R059 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Fhl3Q9R059 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fhl3Q9R059 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fhl3Q9R059 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fhl3Q9R059 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fhl3Q9R059 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Fhl3Q9R059 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fhl3Q9R059 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fhl3Q9R059 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fhl3Q9R059 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fhl3Q9R059 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fhl3Q9R059 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fhl3Q9R059 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fhl3Q9R059 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fhl3Q9R059 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fhl3Q9R059 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fhl3Q9R059 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fhl3Q9R059 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fhl3Q9R059 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fhl3Q9R059 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fhl3Q9R059 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fhl3Q9R059 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Fhl3Q9R059 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fhl3Q9R059 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Fhl3Q9R059 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fhl3Q9R059 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fhl3Q9R059 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fhl3Q9R059 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fhl3Q9R059 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Fhl3Q9R059 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Fhl3Q9R059 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fhl3Q9R059 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fhl3Q9R059 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fhl3Q9R059 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fhl3Q9R059 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fhl3Q9R059 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fhl3Q9R059 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fhl3Q9R059 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fhl3Q9R059 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fhl3Q9R059 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fhl3Q9R059 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fhl3Q9R059 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fhl3Q9R059 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fhl3Q9R059 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fhl3Q9R059 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fhl3Q9R059 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fhl3Q9R059 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fhl3Q9R059 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fhl3Q9R059 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fhl3Q9R059 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fhl3Q9R059 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fhl3Q9R059 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fhl3Q9R059 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fhl3Q9R059 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fhl3Q9R059 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fhl3Q9R059 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fhl3Q9R059 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fhl3Q9R059 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fhl3Q9R059 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fhl3Q9R059 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fhl3Q9R059 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fhl3Q9R059 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fhl3Q9R059 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fhl3Q9R059 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fhl3Q9R059 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Fhl3Q9R059 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fhl3Q9R059 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fhl3Q9R059 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fhl3Q9R059 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fhl3Q9R059 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fhl3Q9R059 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fhl3Q9R059 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fhl3Q9R059 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Fhl3Q9R059 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fhl3Q9R059 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fhl3Q9R059 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fhl3Q9R059 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fhl3Q9R059 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fhl3Q9R059 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fhl3Q9R059 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fhl3Q9R059 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Fhl3Q9R059 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Fhl3Q9R059 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fhl3Q9R059 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fhl3Q9R059 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fhl3Q9R059 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fhl3Q9R059 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fhl3Q9R059 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Fhl3Q9R059 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fhl3Q9R059 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fhl3Q9R059 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fhl3Q9R059 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fhl3Q9R059 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fhl3Q9R059 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fhl3Q9R059 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms