Protein–RNA interactions for Protein: Q9R014

Ctsj, Cathepsin J, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsjQ9R014 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CtsjQ9R014 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CtsjQ9R014 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CtsjQ9R014 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CtsjQ9R014 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CtsjQ9R014 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CtsjQ9R014 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CtsjQ9R014 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CtsjQ9R014 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CtsjQ9R014 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CtsjQ9R014 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CtsjQ9R014 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CtsjQ9R014 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CtsjQ9R014 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CtsjQ9R014 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CtsjQ9R014 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CtsjQ9R014 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CtsjQ9R014 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CtsjQ9R014 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CtsjQ9R014 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CtsjQ9R014 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CtsjQ9R014 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CtsjQ9R014 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CtsjQ9R014 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CtsjQ9R014 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CtsjQ9R014 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CtsjQ9R014 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CtsjQ9R014 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CtsjQ9R014 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CtsjQ9R014 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CtsjQ9R014 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CtsjQ9R014 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CtsjQ9R014 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CtsjQ9R014 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CtsjQ9R014 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CtsjQ9R014 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CtsjQ9R014 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CtsjQ9R014 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CtsjQ9R014 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CtsjQ9R014 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CtsjQ9R014 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CtsjQ9R014 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CtsjQ9R014 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CtsjQ9R014 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CtsjQ9R014 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CtsjQ9R014 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CtsjQ9R014 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CtsjQ9R014 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CtsjQ9R014 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CtsjQ9R014 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CtsjQ9R014 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CtsjQ9R014 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CtsjQ9R014 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CtsjQ9R014 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CtsjQ9R014 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CtsjQ9R014 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CtsjQ9R014 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CtsjQ9R014 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CtsjQ9R014 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CtsjQ9R014 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CtsjQ9R014 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CtsjQ9R014 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CtsjQ9R014 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CtsjQ9R014 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CtsjQ9R014 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CtsjQ9R014 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CtsjQ9R014 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CtsjQ9R014 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CtsjQ9R014 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CtsjQ9R014 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CtsjQ9R014 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CtsjQ9R014 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CtsjQ9R014 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CtsjQ9R014 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CtsjQ9R014 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CtsjQ9R014 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CtsjQ9R014 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CtsjQ9R014 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CtsjQ9R014 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CtsjQ9R014 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CtsjQ9R014 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CtsjQ9R014 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CtsjQ9R014 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CtsjQ9R014 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CtsjQ9R014 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CtsjQ9R014 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CtsjQ9R014 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CtsjQ9R014 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CtsjQ9R014 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CtsjQ9R014 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CtsjQ9R014 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CtsjQ9R014 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CtsjQ9R014 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CtsjQ9R014 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CtsjQ9R014 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CtsjQ9R014 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CtsjQ9R014 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CtsjQ9R014 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CtsjQ9R014 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CtsjQ9R014 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms