Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Npas3Q9QZQ0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Npas3Q9QZQ0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Npas3Q9QZQ0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Npas3Q9QZQ0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Npas3Q9QZQ0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Npas3Q9QZQ0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Npas3Q9QZQ0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Npas3Q9QZQ0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Npas3Q9QZQ0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Npas3Q9QZQ0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Npas3Q9QZQ0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Npas3Q9QZQ0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Npas3Q9QZQ0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Npas3Q9QZQ0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Npas3Q9QZQ0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Npas3Q9QZQ0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Npas3Q9QZQ0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Npas3Q9QZQ0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Npas3Q9QZQ0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Npas3Q9QZQ0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Npas3Q9QZQ0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Npas3Q9QZQ0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Npas3Q9QZQ0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Npas3Q9QZQ0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Npas3Q9QZQ0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Npas3Q9QZQ0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Npas3Q9QZQ0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Npas3Q9QZQ0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Npas3Q9QZQ0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Npas3Q9QZQ0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Npas3Q9QZQ0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Npas3Q9QZQ0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Npas3Q9QZQ0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Npas3Q9QZQ0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Npas3Q9QZQ0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Npas3Q9QZQ0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Npas3Q9QZQ0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Npas3Q9QZQ0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Npas3Q9QZQ0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Npas3Q9QZQ0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Npas3Q9QZQ0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Npas3Q9QZQ0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Npas3Q9QZQ0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Npas3Q9QZQ0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Npas3Q9QZQ0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Npas3Q9QZQ0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Npas3Q9QZQ0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Npas3Q9QZQ0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Npas3Q9QZQ0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Npas3Q9QZQ0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Npas3Q9QZQ0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Npas3Q9QZQ0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Npas3Q9QZQ0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Npas3Q9QZQ0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Npas3Q9QZQ0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Npas3Q9QZQ0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Npas3Q9QZQ0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Npas3Q9QZQ0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Npas3Q9QZQ0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Npas3Q9QZQ0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Npas3Q9QZQ0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Npas3Q9QZQ0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Npas3Q9QZQ0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Npas3Q9QZQ0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Npas3Q9QZQ0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Npas3Q9QZQ0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Npas3Q9QZQ0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Npas3Q9QZQ0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Npas3Q9QZQ0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Npas3Q9QZQ0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Npas3Q9QZQ0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Npas3Q9QZQ0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Npas3Q9QZQ0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Npas3Q9QZQ0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Npas3Q9QZQ0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Npas3Q9QZQ0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Npas3Q9QZQ0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Npas3Q9QZQ0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Npas3Q9QZQ0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Npas3Q9QZQ0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Npas3Q9QZQ0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Npas3Q9QZQ0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Npas3Q9QZQ0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Npas3Q9QZQ0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Npas3Q9QZQ0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Npas3Q9QZQ0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Npas3Q9QZQ0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Npas3Q9QZQ0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Npas3Q9QZQ0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Npas3Q9QZQ0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Npas3Q9QZQ0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Npas3Q9QZQ0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Npas3Q9QZQ0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Npas3Q9QZQ0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Npas3Q9QZQ0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Npas3Q9QZQ0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Npas3Q9QZQ0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Npas3Q9QZQ0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Npas3Q9QZQ0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms