Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ercc4Q9QZD4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ercc4Q9QZD4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ercc4Q9QZD4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ercc4Q9QZD4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ercc4Q9QZD4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ercc4Q9QZD4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ercc4Q9QZD4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ercc4Q9QZD4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ercc4Q9QZD4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ercc4Q9QZD4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ercc4Q9QZD4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ercc4Q9QZD4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ercc4Q9QZD4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ercc4Q9QZD4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ercc4Q9QZD4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ercc4Q9QZD4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ercc4Q9QZD4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ercc4Q9QZD4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ercc4Q9QZD4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ercc4Q9QZD4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ercc4Q9QZD4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ercc4Q9QZD4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ercc4Q9QZD4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ercc4Q9QZD4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ercc4Q9QZD4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ercc4Q9QZD4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ercc4Q9QZD4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ercc4Q9QZD4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ercc4Q9QZD4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ercc4Q9QZD4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ercc4Q9QZD4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ercc4Q9QZD4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ercc4Q9QZD4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ercc4Q9QZD4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ercc4Q9QZD4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ercc4Q9QZD4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ercc4Q9QZD4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ercc4Q9QZD4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ercc4Q9QZD4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ercc4Q9QZD4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ercc4Q9QZD4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ercc4Q9QZD4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ercc4Q9QZD4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ercc4Q9QZD4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ercc4Q9QZD4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ercc4Q9QZD4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ercc4Q9QZD4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ercc4Q9QZD4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ercc4Q9QZD4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ercc4Q9QZD4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ercc4Q9QZD4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ercc4Q9QZD4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ercc4Q9QZD4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ercc4Q9QZD4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ercc4Q9QZD4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ercc4Q9QZD4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ercc4Q9QZD4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ercc4Q9QZD4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ercc4Q9QZD4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ercc4Q9QZD4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ercc4Q9QZD4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ercc4Q9QZD4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ercc4Q9QZD4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ercc4Q9QZD4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ercc4Q9QZD4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ercc4Q9QZD4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ercc4Q9QZD4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ercc4Q9QZD4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ercc4Q9QZD4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ercc4Q9QZD4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ercc4Q9QZD4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ercc4Q9QZD4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ercc4Q9QZD4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ercc4Q9QZD4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ercc4Q9QZD4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ercc4Q9QZD4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ercc4Q9QZD4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ercc4Q9QZD4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ercc4Q9QZD4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ercc4Q9QZD4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ercc4Q9QZD4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ercc4Q9QZD4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ercc4Q9QZD4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ercc4Q9QZD4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ercc4Q9QZD4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ercc4Q9QZD4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ercc4Q9QZD4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ercc4Q9QZD4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ercc4Q9QZD4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ercc4Q9QZD4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ercc4Q9QZD4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ercc4Q9QZD4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ercc4Q9QZD4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ercc4Q9QZD4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ercc4Q9QZD4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ercc4Q9QZD4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ercc4Q9QZD4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ercc4Q9QZD4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ercc4Q9QZD4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.6 ms