Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY30

Abcb11, Bile salt export pump, mousemouse

Predictions only

Length 1,321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb11Q9QY30 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Abcb11Q9QY30 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Abcb11Q9QY30 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Abcb11Q9QY30 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Abcb11Q9QY30 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Abcb11Q9QY30 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Abcb11Q9QY30 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Abcb11Q9QY30 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Abcb11Q9QY30 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Abcb11Q9QY30 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Abcb11Q9QY30 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Abcb11Q9QY30 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Abcb11Q9QY30 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Abcb11Q9QY30 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Abcb11Q9QY30 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Abcb11Q9QY30 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Abcb11Q9QY30 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Abcb11Q9QY30 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Abcb11Q9QY30 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Abcb11Q9QY30 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Abcb11Q9QY30 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Abcb11Q9QY30 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Abcb11Q9QY30 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Abcb11Q9QY30 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Abcb11Q9QY30 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Abcb11Q9QY30 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Abcb11Q9QY30 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Abcb11Q9QY30 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Abcb11Q9QY30 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Abcb11Q9QY30 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Abcb11Q9QY30 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Abcb11Q9QY30 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Abcb11Q9QY30 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Abcb11Q9QY30 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Abcb11Q9QY30 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Abcb11Q9QY30 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Abcb11Q9QY30 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Abcb11Q9QY30 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Abcb11Q9QY30 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Abcb11Q9QY30 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Abcb11Q9QY30 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Abcb11Q9QY30 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Abcb11Q9QY30 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Abcb11Q9QY30 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Abcb11Q9QY30 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Abcb11Q9QY30 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Abcb11Q9QY30 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Abcb11Q9QY30 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Abcb11Q9QY30 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Abcb11Q9QY30 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Abcb11Q9QY30 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Abcb11Q9QY30 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Abcb11Q9QY30 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Abcb11Q9QY30 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Abcb11Q9QY30 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Abcb11Q9QY30 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Abcb11Q9QY30 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Abcb11Q9QY30 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Abcb11Q9QY30 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Abcb11Q9QY30 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Abcb11Q9QY30 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Abcb11Q9QY30 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Abcb11Q9QY30 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Abcb11Q9QY30 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Abcb11Q9QY30 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Abcb11Q9QY30 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Abcb11Q9QY30 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Abcb11Q9QY30 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Abcb11Q9QY30 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Abcb11Q9QY30 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Abcb11Q9QY30 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Abcb11Q9QY30 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Abcb11Q9QY30 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Abcb11Q9QY30 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Abcb11Q9QY30 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Abcb11Q9QY30 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Abcb11Q9QY30 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Abcb11Q9QY30 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Abcb11Q9QY30 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Abcb11Q9QY30 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Abcb11Q9QY30 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Abcb11Q9QY30 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Abcb11Q9QY30 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Abcb11Q9QY30 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Abcb11Q9QY30 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Abcb11Q9QY30 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Abcb11Q9QY30 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Abcb11Q9QY30 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Abcb11Q9QY30 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Abcb11Q9QY30 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Abcb11Q9QY30 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Abcb11Q9QY30 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Abcb11Q9QY30 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Abcb11Q9QY30 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Abcb11Q9QY30 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Abcb11Q9QY30 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Abcb11Q9QY30 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Abcb11Q9QY30 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Abcb11Q9QY30 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Abcb11Q9QY30 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms