Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMC3

Dnaja4, DnaJ homolog subfamily A member 4, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaja4Q9JMC3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dnaja4Q9JMC3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Dnaja4Q9JMC3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dnaja4Q9JMC3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dnaja4Q9JMC3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dnaja4Q9JMC3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dnaja4Q9JMC3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dnaja4Q9JMC3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dnaja4Q9JMC3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dnaja4Q9JMC3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dnaja4Q9JMC3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dnaja4Q9JMC3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dnaja4Q9JMC3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dnaja4Q9JMC3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dnaja4Q9JMC3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dnaja4Q9JMC3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dnaja4Q9JMC3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Dnaja4Q9JMC3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dnaja4Q9JMC3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dnaja4Q9JMC3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dnaja4Q9JMC3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dnaja4Q9JMC3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dnaja4Q9JMC3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dnaja4Q9JMC3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dnaja4Q9JMC3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dnaja4Q9JMC3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dnaja4Q9JMC3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dnaja4Q9JMC3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dnaja4Q9JMC3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dnaja4Q9JMC3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dnaja4Q9JMC3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dnaja4Q9JMC3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dnaja4Q9JMC3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dnaja4Q9JMC3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dnaja4Q9JMC3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dnaja4Q9JMC3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dnaja4Q9JMC3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dnaja4Q9JMC3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dnaja4Q9JMC3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dnaja4Q9JMC3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dnaja4Q9JMC3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dnaja4Q9JMC3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dnaja4Q9JMC3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dnaja4Q9JMC3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dnaja4Q9JMC3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dnaja4Q9JMC3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dnaja4Q9JMC3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dnaja4Q9JMC3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dnaja4Q9JMC3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Dnaja4Q9JMC3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnaja4Q9JMC3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnaja4Q9JMC3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnaja4Q9JMC3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnaja4Q9JMC3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnaja4Q9JMC3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnaja4Q9JMC3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnaja4Q9JMC3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnaja4Q9JMC3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnaja4Q9JMC3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnaja4Q9JMC3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnaja4Q9JMC3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dnaja4Q9JMC3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dnaja4Q9JMC3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dnaja4Q9JMC3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dnaja4Q9JMC3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dnaja4Q9JMC3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dnaja4Q9JMC3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dnaja4Q9JMC3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dnaja4Q9JMC3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dnaja4Q9JMC3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnaja4Q9JMC3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnaja4Q9JMC3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnaja4Q9JMC3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnaja4Q9JMC3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnaja4Q9JMC3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnaja4Q9JMC3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnaja4Q9JMC3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnaja4Q9JMC3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnaja4Q9JMC3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnaja4Q9JMC3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnaja4Q9JMC3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dnaja4Q9JMC3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dnaja4Q9JMC3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dnaja4Q9JMC3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dnaja4Q9JMC3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dnaja4Q9JMC3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dnaja4Q9JMC3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dnaja4Q9JMC3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dnaja4Q9JMC3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dnaja4Q9JMC3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dnaja4Q9JMC3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dnaja4Q9JMC3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dnaja4Q9JMC3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dnaja4Q9JMC3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dnaja4Q9JMC3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dnaja4Q9JMC3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dnaja4Q9JMC3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dnaja4Q9JMC3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dnaja4Q9JMC3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dnaja4Q9JMC3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms