Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMA7

Cyp3a41a, Cytochrome P450 3A41, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp3a41aQ9JMA7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Cyp3a41aQ9JMA7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cyp3a41aQ9JMA7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cyp3a41aQ9JMA7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cyp3a41aQ9JMA7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cyp3a41aQ9JMA7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cyp3a41aQ9JMA7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cyp3a41aQ9JMA7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cyp3a41aQ9JMA7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cyp3a41aQ9JMA7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cyp3a41aQ9JMA7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cyp3a41aQ9JMA7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cyp3a41aQ9JMA7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cyp3a41aQ9JMA7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cyp3a41aQ9JMA7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cyp3a41aQ9JMA7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cyp3a41aQ9JMA7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cyp3a41aQ9JMA7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyp3a41aQ9JMA7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp3a41aQ9JMA7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp3a41aQ9JMA7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyp3a41aQ9JMA7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cyp3a41aQ9JMA7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cyp3a41aQ9JMA7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cyp3a41aQ9JMA7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cyp3a41aQ9JMA7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cyp3a41aQ9JMA7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cyp3a41aQ9JMA7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cyp3a41aQ9JMA7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cyp3a41aQ9JMA7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyp3a41aQ9JMA7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyp3a41aQ9JMA7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyp3a41aQ9JMA7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyp3a41aQ9JMA7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyp3a41aQ9JMA7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyp3a41aQ9JMA7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyp3a41aQ9JMA7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyp3a41aQ9JMA7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyp3a41aQ9JMA7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyp3a41aQ9JMA7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyp3a41aQ9JMA7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyp3a41aQ9JMA7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyp3a41aQ9JMA7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyp3a41aQ9JMA7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyp3a41aQ9JMA7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyp3a41aQ9JMA7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyp3a41aQ9JMA7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyp3a41aQ9JMA7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyp3a41aQ9JMA7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms