Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV6

Pnkp, Bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnkpQ9JLV6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PnkpQ9JLV6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PnkpQ9JLV6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PnkpQ9JLV6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PnkpQ9JLV6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PnkpQ9JLV6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PnkpQ9JLV6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PnkpQ9JLV6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PnkpQ9JLV6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PnkpQ9JLV6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PnkpQ9JLV6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PnkpQ9JLV6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PnkpQ9JLV6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PnkpQ9JLV6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PnkpQ9JLV6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PnkpQ9JLV6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PnkpQ9JLV6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PnkpQ9JLV6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PnkpQ9JLV6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PnkpQ9JLV6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PnkpQ9JLV6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PnkpQ9JLV6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PnkpQ9JLV6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PnkpQ9JLV6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PnkpQ9JLV6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PnkpQ9JLV6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PnkpQ9JLV6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PnkpQ9JLV6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PnkpQ9JLV6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PnkpQ9JLV6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PnkpQ9JLV6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PnkpQ9JLV6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PnkpQ9JLV6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PnkpQ9JLV6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PnkpQ9JLV6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PnkpQ9JLV6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PnkpQ9JLV6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PnkpQ9JLV6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PnkpQ9JLV6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PnkpQ9JLV6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PnkpQ9JLV6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PnkpQ9JLV6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PnkpQ9JLV6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PnkpQ9JLV6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PnkpQ9JLV6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PnkpQ9JLV6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PnkpQ9JLV6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PnkpQ9JLV6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PnkpQ9JLV6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PnkpQ9JLV6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PnkpQ9JLV6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PnkpQ9JLV6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PnkpQ9JLV6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PnkpQ9JLV6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PnkpQ9JLV6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PnkpQ9JLV6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PnkpQ9JLV6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PnkpQ9JLV6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PnkpQ9JLV6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PnkpQ9JLV6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PnkpQ9JLV6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PnkpQ9JLV6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PnkpQ9JLV6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PnkpQ9JLV6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PnkpQ9JLV6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PnkpQ9JLV6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PnkpQ9JLV6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PnkpQ9JLV6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PnkpQ9JLV6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PnkpQ9JLV6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PnkpQ9JLV6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PnkpQ9JLV6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PnkpQ9JLV6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PnkpQ9JLV6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PnkpQ9JLV6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PnkpQ9JLV6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PnkpQ9JLV6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PnkpQ9JLV6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PnkpQ9JLV6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PnkpQ9JLV6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PnkpQ9JLV6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PnkpQ9JLV6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PnkpQ9JLV6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PnkpQ9JLV6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PnkpQ9JLV6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PnkpQ9JLV6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PnkpQ9JLV6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PnkpQ9JLV6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PnkpQ9JLV6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PnkpQ9JLV6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PnkpQ9JLV6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PnkpQ9JLV6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PnkpQ9JLV6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PnkpQ9JLV6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PnkpQ9JLV6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PnkpQ9JLV6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PnkpQ9JLV6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PnkpQ9JLV6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PnkpQ9JLV6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PnkpQ9JLV6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms