Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV5

Cul3, Cullin-3, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul3Q9JLV5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cul3Q9JLV5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cul3Q9JLV5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cul3Q9JLV5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cul3Q9JLV5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cul3Q9JLV5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cul3Q9JLV5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cul3Q9JLV5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cul3Q9JLV5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cul3Q9JLV5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cul3Q9JLV5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cul3Q9JLV5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cul3Q9JLV5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cul3Q9JLV5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cul3Q9JLV5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cul3Q9JLV5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cul3Q9JLV5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cul3Q9JLV5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cul3Q9JLV5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cul3Q9JLV5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cul3Q9JLV5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cul3Q9JLV5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cul3Q9JLV5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cul3Q9JLV5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cul3Q9JLV5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cul3Q9JLV5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cul3Q9JLV5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cul3Q9JLV5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cul3Q9JLV5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cul3Q9JLV5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cul3Q9JLV5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cul3Q9JLV5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cul3Q9JLV5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cul3Q9JLV5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cul3Q9JLV5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cul3Q9JLV5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cul3Q9JLV5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cul3Q9JLV5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cul3Q9JLV5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cul3Q9JLV5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cul3Q9JLV5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cul3Q9JLV5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cul3Q9JLV5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cul3Q9JLV5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cul3Q9JLV5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cul3Q9JLV5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cul3Q9JLV5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cul3Q9JLV5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cul3Q9JLV5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cul3Q9JLV5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cul3Q9JLV5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cul3Q9JLV5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cul3Q9JLV5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cul3Q9JLV5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cul3Q9JLV5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cul3Q9JLV5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cul3Q9JLV5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cul3Q9JLV5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cul3Q9JLV5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cul3Q9JLV5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cul3Q9JLV5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cul3Q9JLV5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cul3Q9JLV5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cul3Q9JLV5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cul3Q9JLV5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cul3Q9JLV5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cul3Q9JLV5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cul3Q9JLV5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cul3Q9JLV5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cul3Q9JLV5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cul3Q9JLV5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cul3Q9JLV5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cul3Q9JLV5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cul3Q9JLV5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cul3Q9JLV5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cul3Q9JLV5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cul3Q9JLV5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cul3Q9JLV5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cul3Q9JLV5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cul3Q9JLV5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cul3Q9JLV5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cul3Q9JLV5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cul3Q9JLV5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cul3Q9JLV5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cul3Q9JLV5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cul3Q9JLV5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cul3Q9JLV5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cul3Q9JLV5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cul3Q9JLV5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cul3Q9JLV5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cul3Q9JLV5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cul3Q9JLV5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cul3Q9JLV5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cul3Q9JLV5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cul3Q9JLV5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cul3Q9JLV5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cul3Q9JLV5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cul3Q9JLV5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cul3Q9JLV5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cul3Q9JLV5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms