Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pole3Q9JKP7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pole3Q9JKP7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pole3Q9JKP7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pole3Q9JKP7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pole3Q9JKP7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pole3Q9JKP7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pole3Q9JKP7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pole3Q9JKP7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pole3Q9JKP7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pole3Q9JKP7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pole3Q9JKP7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pole3Q9JKP7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pole3Q9JKP7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pole3Q9JKP7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pole3Q9JKP7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pole3Q9JKP7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pole3Q9JKP7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pole3Q9JKP7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pole3Q9JKP7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Pole3Q9JKP7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pole3Q9JKP7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pole3Q9JKP7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pole3Q9JKP7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pole3Q9JKP7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pole3Q9JKP7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pole3Q9JKP7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pole3Q9JKP7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pole3Q9JKP7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pole3Q9JKP7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pole3Q9JKP7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pole3Q9JKP7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pole3Q9JKP7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pole3Q9JKP7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pole3Q9JKP7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pole3Q9JKP7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pole3Q9JKP7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pole3Q9JKP7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Pole3Q9JKP7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pole3Q9JKP7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pole3Q9JKP7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pole3Q9JKP7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pole3Q9JKP7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pole3Q9JKP7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pole3Q9JKP7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pole3Q9JKP7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Pole3Q9JKP7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pole3Q9JKP7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pole3Q9JKP7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pole3Q9JKP7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Pole3Q9JKP7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pole3Q9JKP7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pole3Q9JKP7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pole3Q9JKP7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Pole3Q9JKP7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Pole3Q9JKP7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pole3Q9JKP7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pole3Q9JKP7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pole3Q9JKP7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pole3Q9JKP7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pole3Q9JKP7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pole3Q9JKP7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pole3Q9JKP7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pole3Q9JKP7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pole3Q9JKP7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pole3Q9JKP7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pole3Q9JKP7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pole3Q9JKP7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pole3Q9JKP7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Pole3Q9JKP7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pole3Q9JKP7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pole3Q9JKP7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pole3Q9JKP7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pole3Q9JKP7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pole3Q9JKP7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pole3Q9JKP7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Pole3Q9JKP7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pole3Q9JKP7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Pole3Q9JKP7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Pole3Q9JKP7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pole3Q9JKP7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pole3Q9JKP7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pole3Q9JKP7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pole3Q9JKP7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pole3Q9JKP7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pole3Q9JKP7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pole3Q9JKP7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pole3Q9JKP7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pole3Q9JKP7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pole3Q9JKP7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pole3Q9JKP7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pole3Q9JKP7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pole3Q9JKP7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pole3Q9JKP7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pole3Q9JKP7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pole3Q9JKP7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pole3Q9JKP7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pole3Q9JKP7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pole3Q9JKP7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pole3Q9JKP7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms