Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKN6

Nova1, RNA-binding protein Nova-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nova1Q9JKN6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nova1Q9JKN6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nova1Q9JKN6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nova1Q9JKN6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nova1Q9JKN6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nova1Q9JKN6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nova1Q9JKN6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nova1Q9JKN6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nova1Q9JKN6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Nova1Q9JKN6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nova1Q9JKN6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nova1Q9JKN6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nova1Q9JKN6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nova1Q9JKN6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nova1Q9JKN6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nova1Q9JKN6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nova1Q9JKN6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nova1Q9JKN6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nova1Q9JKN6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nova1Q9JKN6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nova1Q9JKN6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nova1Q9JKN6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nova1Q9JKN6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nova1Q9JKN6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Nova1Q9JKN6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Nova1Q9JKN6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Nova1Q9JKN6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nova1Q9JKN6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nova1Q9JKN6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nova1Q9JKN6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nova1Q9JKN6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Nova1Q9JKN6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nova1Q9JKN6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nova1Q9JKN6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nova1Q9JKN6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nova1Q9JKN6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nova1Q9JKN6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nova1Q9JKN6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nova1Q9JKN6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nova1Q9JKN6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nova1Q9JKN6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nova1Q9JKN6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nova1Q9JKN6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nova1Q9JKN6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nova1Q9JKN6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nova1Q9JKN6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nova1Q9JKN6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nova1Q9JKN6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nova1Q9JKN6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nova1Q9JKN6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nova1Q9JKN6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nova1Q9JKN6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nova1Q9JKN6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nova1Q9JKN6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nova1Q9JKN6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nova1Q9JKN6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nova1Q9JKN6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nova1Q9JKN6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nova1Q9JKN6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nova1Q9JKN6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nova1Q9JKN6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nova1Q9JKN6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nova1Q9JKN6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nova1Q9JKN6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nova1Q9JKN6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nova1Q9JKN6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Nova1Q9JKN6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nova1Q9JKN6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nova1Q9JKN6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nova1Q9JKN6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nova1Q9JKN6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nova1Q9JKN6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Nova1Q9JKN6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Nova1Q9JKN6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Nova1Q9JKN6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Nova1Q9JKN6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nova1Q9JKN6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nova1Q9JKN6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nova1Q9JKN6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nova1Q9JKN6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nova1Q9JKN6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nova1Q9JKN6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nova1Q9JKN6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nova1Q9JKN6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nova1Q9JKN6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nova1Q9JKN6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nova1Q9JKN6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nova1Q9JKN6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nova1Q9JKN6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nova1Q9JKN6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nova1Q9JKN6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Nova1Q9JKN6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nova1Q9JKN6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nova1Q9JKN6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nova1Q9JKN6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nova1Q9JKN6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nova1Q9JKN6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nova1Q9JKN6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nova1Q9JKN6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nova1Q9JKN6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms