Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scamp5Q9JKD3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scamp5Q9JKD3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scamp5Q9JKD3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Scamp5Q9JKD3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Scamp5Q9JKD3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Scamp5Q9JKD3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Scamp5Q9JKD3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scamp5Q9JKD3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scamp5Q9JKD3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scamp5Q9JKD3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scamp5Q9JKD3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scamp5Q9JKD3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scamp5Q9JKD3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scamp5Q9JKD3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scamp5Q9JKD3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Scamp5Q9JKD3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scamp5Q9JKD3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scamp5Q9JKD3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scamp5Q9JKD3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scamp5Q9JKD3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scamp5Q9JKD3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scamp5Q9JKD3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scamp5Q9JKD3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scamp5Q9JKD3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scamp5Q9JKD3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scamp5Q9JKD3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scamp5Q9JKD3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scamp5Q9JKD3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scamp5Q9JKD3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scamp5Q9JKD3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scamp5Q9JKD3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scamp5Q9JKD3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scamp5Q9JKD3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scamp5Q9JKD3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scamp5Q9JKD3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scamp5Q9JKD3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scamp5Q9JKD3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scamp5Q9JKD3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scamp5Q9JKD3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scamp5Q9JKD3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scamp5Q9JKD3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Scamp5Q9JKD3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scamp5Q9JKD3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scamp5Q9JKD3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scamp5Q9JKD3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scamp5Q9JKD3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scamp5Q9JKD3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scamp5Q9JKD3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scamp5Q9JKD3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Scamp5Q9JKD3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Scamp5Q9JKD3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scamp5Q9JKD3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scamp5Q9JKD3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scamp5Q9JKD3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scamp5Q9JKD3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scamp5Q9JKD3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scamp5Q9JKD3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scamp5Q9JKD3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scamp5Q9JKD3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scamp5Q9JKD3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scamp5Q9JKD3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scamp5Q9JKD3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scamp5Q9JKD3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scamp5Q9JKD3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scamp5Q9JKD3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scamp5Q9JKD3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scamp5Q9JKD3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scamp5Q9JKD3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scamp5Q9JKD3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scamp5Q9JKD3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scamp5Q9JKD3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Scamp5Q9JKD3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Scamp5Q9JKD3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Scamp5Q9JKD3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scamp5Q9JKD3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scamp5Q9JKD3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Scamp5Q9JKD3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scamp5Q9JKD3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scamp5Q9JKD3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scamp5Q9JKD3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scamp5Q9JKD3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scamp5Q9JKD3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scamp5Q9JKD3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scamp5Q9JKD3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scamp5Q9JKD3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scamp5Q9JKD3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scamp5Q9JKD3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Scamp5Q9JKD3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scamp5Q9JKD3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scamp5Q9JKD3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scamp5Q9JKD3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scamp5Q9JKD3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scamp5Q9JKD3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scamp5Q9JKD3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scamp5Q9JKD3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Scamp5Q9JKD3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scamp5Q9JKD3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scamp5Q9JKD3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scamp5Q9JKD3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.8 ms