Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Uchl3Q9JKB1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Uchl3Q9JKB1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Uchl3Q9JKB1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Uchl3Q9JKB1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Uchl3Q9JKB1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Uchl3Q9JKB1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Uchl3Q9JKB1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Uchl3Q9JKB1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Uchl3Q9JKB1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Uchl3Q9JKB1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Uchl3Q9JKB1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Uchl3Q9JKB1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Uchl3Q9JKB1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Uchl3Q9JKB1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Uchl3Q9JKB1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Uchl3Q9JKB1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Uchl3Q9JKB1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Uchl3Q9JKB1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Uchl3Q9JKB1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Uchl3Q9JKB1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Uchl3Q9JKB1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Uchl3Q9JKB1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Uchl3Q9JKB1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Uchl3Q9JKB1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Uchl3Q9JKB1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Uchl3Q9JKB1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Uchl3Q9JKB1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Uchl3Q9JKB1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Uchl3Q9JKB1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Uchl3Q9JKB1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Uchl3Q9JKB1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Uchl3Q9JKB1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Uchl3Q9JKB1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Uchl3Q9JKB1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Uchl3Q9JKB1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Uchl3Q9JKB1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Uchl3Q9JKB1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Uchl3Q9JKB1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Uchl3Q9JKB1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Uchl3Q9JKB1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Uchl3Q9JKB1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Uchl3Q9JKB1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Uchl3Q9JKB1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Uchl3Q9JKB1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Uchl3Q9JKB1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Uchl3Q9JKB1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Uchl3Q9JKB1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Uchl3Q9JKB1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Uchl3Q9JKB1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Uchl3Q9JKB1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Uchl3Q9JKB1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Uchl3Q9JKB1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Uchl3Q9JKB1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Uchl3Q9JKB1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Uchl3Q9JKB1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.39
Uchl3Q9JKB1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Uchl3Q9JKB1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Uchl3Q9JKB1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Uchl3Q9JKB1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Uchl3Q9JKB1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Uchl3Q9JKB1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Uchl3Q9JKB1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Uchl3Q9JKB1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Uchl3Q9JKB1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Uchl3Q9JKB1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Uchl3Q9JKB1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Uchl3Q9JKB1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Uchl3Q9JKB1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Uchl3Q9JKB1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Uchl3Q9JKB1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Uchl3Q9JKB1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Uchl3Q9JKB1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Uchl3Q9JKB1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Uchl3Q9JKB1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Uchl3Q9JKB1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Uchl3Q9JKB1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Uchl3Q9JKB1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Uchl3Q9JKB1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Uchl3Q9JKB1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Uchl3Q9JKB1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Uchl3Q9JKB1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Uchl3Q9JKB1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Uchl3Q9JKB1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Uchl3Q9JKB1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Uchl3Q9JKB1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Uchl3Q9JKB1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Uchl3Q9JKB1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Uchl3Q9JKB1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Uchl3Q9JKB1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Uchl3Q9JKB1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Uchl3Q9JKB1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Uchl3Q9JKB1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Uchl3Q9JKB1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Uchl3Q9JKB1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Uchl3Q9JKB1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Uchl3Q9JKB1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Uchl3Q9JKB1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Uchl3Q9JKB1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Uchl3Q9JKB1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.9 ms