Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tuba8Q9JJZ2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tuba8Q9JJZ2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tuba8Q9JJZ2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tuba8Q9JJZ2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tuba8Q9JJZ2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tuba8Q9JJZ2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tuba8Q9JJZ2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tuba8Q9JJZ2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Tuba8Q9JJZ2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tuba8Q9JJZ2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tuba8Q9JJZ2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tuba8Q9JJZ2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tuba8Q9JJZ2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tuba8Q9JJZ2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Tuba8Q9JJZ2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Tuba8Q9JJZ2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tuba8Q9JJZ2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tuba8Q9JJZ2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tuba8Q9JJZ2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tuba8Q9JJZ2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tuba8Q9JJZ2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tuba8Q9JJZ2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tuba8Q9JJZ2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Tuba8Q9JJZ2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tuba8Q9JJZ2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tuba8Q9JJZ2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tuba8Q9JJZ2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tuba8Q9JJZ2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tuba8Q9JJZ2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tuba8Q9JJZ2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tuba8Q9JJZ2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tuba8Q9JJZ2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tuba8Q9JJZ2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tuba8Q9JJZ2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tuba8Q9JJZ2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tuba8Q9JJZ2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tuba8Q9JJZ2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tuba8Q9JJZ2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tuba8Q9JJZ2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tuba8Q9JJZ2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tuba8Q9JJZ2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tuba8Q9JJZ2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tuba8Q9JJZ2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tuba8Q9JJZ2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tuba8Q9JJZ2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tuba8Q9JJZ2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tuba8Q9JJZ2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tuba8Q9JJZ2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tuba8Q9JJZ2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tuba8Q9JJZ2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tuba8Q9JJZ2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tuba8Q9JJZ2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Tuba8Q9JJZ2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tuba8Q9JJZ2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tuba8Q9JJZ2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tuba8Q9JJZ2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tuba8Q9JJZ2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Tuba8Q9JJZ2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tuba8Q9JJZ2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tuba8Q9JJZ2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tuba8Q9JJZ2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tuba8Q9JJZ2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tuba8Q9JJZ2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tuba8Q9JJZ2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tuba8Q9JJZ2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tuba8Q9JJZ2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tuba8Q9JJZ2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tuba8Q9JJZ2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tuba8Q9JJZ2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tuba8Q9JJZ2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tuba8Q9JJZ2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tuba8Q9JJZ2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tuba8Q9JJZ2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tuba8Q9JJZ2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tuba8Q9JJZ2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tuba8Q9JJZ2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tuba8Q9JJZ2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tuba8Q9JJZ2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tuba8Q9JJZ2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tuba8Q9JJZ2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tuba8Q9JJZ2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tuba8Q9JJZ2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tuba8Q9JJZ2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tuba8Q9JJZ2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tuba8Q9JJZ2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tuba8Q9JJZ2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tuba8Q9JJZ2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tuba8Q9JJZ2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tuba8Q9JJZ2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tuba8Q9JJZ2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tuba8Q9JJZ2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Tuba8Q9JJZ2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tuba8Q9JJZ2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tuba8Q9JJZ2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tuba8Q9JJZ2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Tuba8Q9JJZ2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Tuba8Q9JJZ2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tuba8Q9JJZ2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tuba8Q9JJZ2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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