Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJK5

Herpud1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herpud1Q9JJK5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Herpud1Q9JJK5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Herpud1Q9JJK5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Herpud1Q9JJK5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Herpud1Q9JJK5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Herpud1Q9JJK5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Herpud1Q9JJK5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Herpud1Q9JJK5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Herpud1Q9JJK5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Herpud1Q9JJK5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Herpud1Q9JJK5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Herpud1Q9JJK5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Herpud1Q9JJK5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Herpud1Q9JJK5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Herpud1Q9JJK5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Herpud1Q9JJK5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Herpud1Q9JJK5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Herpud1Q9JJK5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Herpud1Q9JJK5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Herpud1Q9JJK5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Herpud1Q9JJK5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Herpud1Q9JJK5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Herpud1Q9JJK5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Herpud1Q9JJK5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Herpud1Q9JJK5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Herpud1Q9JJK5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Herpud1Q9JJK5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Herpud1Q9JJK5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Herpud1Q9JJK5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Herpud1Q9JJK5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Herpud1Q9JJK5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Herpud1Q9JJK5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Herpud1Q9JJK5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Herpud1Q9JJK5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Herpud1Q9JJK5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Herpud1Q9JJK5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Herpud1Q9JJK5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Herpud1Q9JJK5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Herpud1Q9JJK5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Herpud1Q9JJK5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Herpud1Q9JJK5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Herpud1Q9JJK5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Herpud1Q9JJK5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Herpud1Q9JJK5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Herpud1Q9JJK5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Herpud1Q9JJK5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Herpud1Q9JJK5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Herpud1Q9JJK5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Herpud1Q9JJK5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Herpud1Q9JJK5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Herpud1Q9JJK5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Herpud1Q9JJK5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Herpud1Q9JJK5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Herpud1Q9JJK5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Herpud1Q9JJK5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Herpud1Q9JJK5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Herpud1Q9JJK5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Herpud1Q9JJK5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Herpud1Q9JJK5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Herpud1Q9JJK5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Herpud1Q9JJK5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Herpud1Q9JJK5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Herpud1Q9JJK5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Herpud1Q9JJK5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Herpud1Q9JJK5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Herpud1Q9JJK5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Herpud1Q9JJK5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Herpud1Q9JJK5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Herpud1Q9JJK5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Herpud1Q9JJK5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Herpud1Q9JJK5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Herpud1Q9JJK5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Herpud1Q9JJK5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Herpud1Q9JJK5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Herpud1Q9JJK5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Herpud1Q9JJK5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Herpud1Q9JJK5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Herpud1Q9JJK5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Herpud1Q9JJK5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Herpud1Q9JJK5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Herpud1Q9JJK5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Herpud1Q9JJK5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Herpud1Q9JJK5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Herpud1Q9JJK5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Herpud1Q9JJK5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Herpud1Q9JJK5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Herpud1Q9JJK5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Herpud1Q9JJK5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Herpud1Q9JJK5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Herpud1Q9JJK5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Herpud1Q9JJK5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Herpud1Q9JJK5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Herpud1Q9JJK5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Herpud1Q9JJK5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Herpud1Q9JJK5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Herpud1Q9JJK5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Herpud1Q9JJK5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Herpud1Q9JJK5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Herpud1Q9JJK5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Herpud1Q9JJK5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms