Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJA4

Wdr12, Ribosome biogenesis protein WDR12, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr12Q9JJA4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Wdr12Q9JJA4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Wdr12Q9JJA4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Wdr12Q9JJA4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Wdr12Q9JJA4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Wdr12Q9JJA4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Wdr12Q9JJA4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Wdr12Q9JJA4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Wdr12Q9JJA4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Wdr12Q9JJA4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Wdr12Q9JJA4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Wdr12Q9JJA4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Wdr12Q9JJA4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Wdr12Q9JJA4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Wdr12Q9JJA4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Wdr12Q9JJA4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Wdr12Q9JJA4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Wdr12Q9JJA4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Wdr12Q9JJA4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Wdr12Q9JJA4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Wdr12Q9JJA4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Wdr12Q9JJA4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Wdr12Q9JJA4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Wdr12Q9JJA4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Wdr12Q9JJA4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Wdr12Q9JJA4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Wdr12Q9JJA4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Wdr12Q9JJA4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Wdr12Q9JJA4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Wdr12Q9JJA4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Wdr12Q9JJA4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Wdr12Q9JJA4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Wdr12Q9JJA4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Wdr12Q9JJA4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Wdr12Q9JJA4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Wdr12Q9JJA4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Wdr12Q9JJA4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Wdr12Q9JJA4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Wdr12Q9JJA4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Wdr12Q9JJA4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Wdr12Q9JJA4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Wdr12Q9JJA4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Wdr12Q9JJA4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Wdr12Q9JJA4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Wdr12Q9JJA4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Wdr12Q9JJA4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Wdr12Q9JJA4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Wdr12Q9JJA4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Wdr12Q9JJA4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Wdr12Q9JJA4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Wdr12Q9JJA4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Wdr12Q9JJA4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Wdr12Q9JJA4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Wdr12Q9JJA4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Wdr12Q9JJA4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Wdr12Q9JJA4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Wdr12Q9JJA4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Wdr12Q9JJA4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Wdr12Q9JJA4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Wdr12Q9JJA4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Wdr12Q9JJA4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Wdr12Q9JJA4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Wdr12Q9JJA4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Wdr12Q9JJA4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Wdr12Q9JJA4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Wdr12Q9JJA4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Wdr12Q9JJA4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Wdr12Q9JJA4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Wdr12Q9JJA4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Wdr12Q9JJA4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Wdr12Q9JJA4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Wdr12Q9JJA4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Wdr12Q9JJA4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Wdr12Q9JJA4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Wdr12Q9JJA4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Wdr12Q9JJA4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Wdr12Q9JJA4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Wdr12Q9JJA4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Wdr12Q9JJA4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Wdr12Q9JJA4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Wdr12Q9JJA4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Wdr12Q9JJA4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Wdr12Q9JJA4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Wdr12Q9JJA4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Wdr12Q9JJA4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Wdr12Q9JJA4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Wdr12Q9JJA4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Wdr12Q9JJA4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Wdr12Q9JJA4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Wdr12Q9JJA4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Wdr12Q9JJA4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Wdr12Q9JJA4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Wdr12Q9JJA4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Wdr12Q9JJA4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Wdr12Q9JJA4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Wdr12Q9JJA4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Wdr12Q9JJA4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Wdr12Q9JJA4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Wdr12Q9JJA4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Wdr12Q9JJA4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms