Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc86Q9JJ89 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc86Q9JJ89 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc86Q9JJ89 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc86Q9JJ89 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc86Q9JJ89 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc86Q9JJ89 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc86Q9JJ89 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc86Q9JJ89 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc86Q9JJ89 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc86Q9JJ89 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc86Q9JJ89 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc86Q9JJ89 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc86Q9JJ89 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc86Q9JJ89 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc86Q9JJ89 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc86Q9JJ89 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc86Q9JJ89 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc86Q9JJ89 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc86Q9JJ89 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc86Q9JJ89 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc86Q9JJ89 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc86Q9JJ89 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc86Q9JJ89 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc86Q9JJ89 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc86Q9JJ89 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc86Q9JJ89 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc86Q9JJ89 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc86Q9JJ89 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc86Q9JJ89 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc86Q9JJ89 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc86Q9JJ89 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc86Q9JJ89 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc86Q9JJ89 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc86Q9JJ89 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc86Q9JJ89 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc86Q9JJ89 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc86Q9JJ89 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc86Q9JJ89 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc86Q9JJ89 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc86Q9JJ89 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc86Q9JJ89 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc86Q9JJ89 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc86Q9JJ89 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc86Q9JJ89 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc86Q9JJ89 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc86Q9JJ89 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc86Q9JJ89 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc86Q9JJ89 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc86Q9JJ89 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc86Q9JJ89 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc86Q9JJ89 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc86Q9JJ89 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc86Q9JJ89 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc86Q9JJ89 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc86Q9JJ89 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc86Q9JJ89 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc86Q9JJ89 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc86Q9JJ89 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc86Q9JJ89 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc86Q9JJ89 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc86Q9JJ89 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc86Q9JJ89 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc86Q9JJ89 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc86Q9JJ89 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc86Q9JJ89 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc86Q9JJ89 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc86Q9JJ89 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc86Q9JJ89 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc86Q9JJ89 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc86Q9JJ89 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc86Q9JJ89 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc86Q9JJ89 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc86Q9JJ89 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc86Q9JJ89 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc86Q9JJ89 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc86Q9JJ89 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc86Q9JJ89 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ccdc86Q9JJ89 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc86Q9JJ89 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc86Q9JJ89 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc86Q9JJ89 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc86Q9JJ89 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc86Q9JJ89 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc86Q9JJ89 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc86Q9JJ89 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc86Q9JJ89 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc86Q9JJ89 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc86Q9JJ89 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc86Q9JJ89 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc86Q9JJ89 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc86Q9JJ89 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc86Q9JJ89 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc86Q9JJ89 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc86Q9JJ89 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc86Q9JJ89 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc86Q9JJ89 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc86Q9JJ89 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc86Q9JJ89 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc86Q9JJ89 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.4 ms