Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lmbr1Q9JIT0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lmbr1Q9JIT0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lmbr1Q9JIT0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lmbr1Q9JIT0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lmbr1Q9JIT0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Lmbr1Q9JIT0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lmbr1Q9JIT0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lmbr1Q9JIT0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Lmbr1Q9JIT0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lmbr1Q9JIT0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lmbr1Q9JIT0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lmbr1Q9JIT0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lmbr1Q9JIT0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lmbr1Q9JIT0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Lmbr1Q9JIT0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Lmbr1Q9JIT0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Lmbr1Q9JIT0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lmbr1Q9JIT0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lmbr1Q9JIT0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lmbr1Q9JIT0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lmbr1Q9JIT0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lmbr1Q9JIT0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Lmbr1Q9JIT0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Lmbr1Q9JIT0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lmbr1Q9JIT0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lmbr1Q9JIT0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lmbr1Q9JIT0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lmbr1Q9JIT0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lmbr1Q9JIT0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lmbr1Q9JIT0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lmbr1Q9JIT0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lmbr1Q9JIT0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lmbr1Q9JIT0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Lmbr1Q9JIT0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lmbr1Q9JIT0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lmbr1Q9JIT0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lmbr1Q9JIT0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lmbr1Q9JIT0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lmbr1Q9JIT0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lmbr1Q9JIT0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lmbr1Q9JIT0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lmbr1Q9JIT0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lmbr1Q9JIT0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lmbr1Q9JIT0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lmbr1Q9JIT0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lmbr1Q9JIT0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lmbr1Q9JIT0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Lmbr1Q9JIT0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Lmbr1Q9JIT0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lmbr1Q9JIT0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lmbr1Q9JIT0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lmbr1Q9JIT0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lmbr1Q9JIT0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lmbr1Q9JIT0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lmbr1Q9JIT0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lmbr1Q9JIT0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lmbr1Q9JIT0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lmbr1Q9JIT0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Lmbr1Q9JIT0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lmbr1Q9JIT0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lmbr1Q9JIT0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lmbr1Q9JIT0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lmbr1Q9JIT0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lmbr1Q9JIT0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lmbr1Q9JIT0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lmbr1Q9JIT0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lmbr1Q9JIT0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Lmbr1Q9JIT0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lmbr1Q9JIT0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lmbr1Q9JIT0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lmbr1Q9JIT0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lmbr1Q9JIT0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lmbr1Q9JIT0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lmbr1Q9JIT0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lmbr1Q9JIT0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lmbr1Q9JIT0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lmbr1Q9JIT0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Lmbr1Q9JIT0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lmbr1Q9JIT0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lmbr1Q9JIT0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lmbr1Q9JIT0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lmbr1Q9JIT0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lmbr1Q9JIT0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lmbr1Q9JIT0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lmbr1Q9JIT0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lmbr1Q9JIT0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lmbr1Q9JIT0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lmbr1Q9JIT0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lmbr1Q9JIT0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Lmbr1Q9JIT0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Lmbr1Q9JIT0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lmbr1Q9JIT0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lmbr1Q9JIT0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lmbr1Q9JIT0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Lmbr1Q9JIT0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lmbr1Q9JIT0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lmbr1Q9JIT0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lmbr1Q9JIT0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 153.2 ms