Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG4

Ppp1r3f, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3F, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r3fQ9JIG4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ppp1r3fQ9JIG4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ppp1r3fQ9JIG4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ppp1r3fQ9JIG4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Ppp1r3fQ9JIG4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ppp1r3fQ9JIG4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ppp1r3fQ9JIG4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ppp1r3fQ9JIG4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ppp1r3fQ9JIG4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ppp1r3fQ9JIG4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ppp1r3fQ9JIG4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ppp1r3fQ9JIG4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ppp1r3fQ9JIG4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ppp1r3fQ9JIG4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ppp1r3fQ9JIG4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ppp1r3fQ9JIG4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ppp1r3fQ9JIG4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ppp1r3fQ9JIG4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ppp1r3fQ9JIG4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ppp1r3fQ9JIG4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ppp1r3fQ9JIG4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ppp1r3fQ9JIG4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ppp1r3fQ9JIG4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Ppp1r3fQ9JIG4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ppp1r3fQ9JIG4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ppp1r3fQ9JIG4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ppp1r3fQ9JIG4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ppp1r3fQ9JIG4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ppp1r3fQ9JIG4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Ppp1r3fQ9JIG4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ppp1r3fQ9JIG4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ppp1r3fQ9JIG4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ppp1r3fQ9JIG4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ppp1r3fQ9JIG4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ppp1r3fQ9JIG4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ppp1r3fQ9JIG4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ppp1r3fQ9JIG4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ppp1r3fQ9JIG4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ppp1r3fQ9JIG4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ppp1r3fQ9JIG4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Ppp1r3fQ9JIG4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ppp1r3fQ9JIG4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ppp1r3fQ9JIG4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ppp1r3fQ9JIG4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ppp1r3fQ9JIG4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ppp1r3fQ9JIG4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
Ppp1r3fQ9JIG4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ppp1r3fQ9JIG4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ppp1r3fQ9JIG4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Ppp1r3fQ9JIG4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ppp1r3fQ9JIG4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ppp1r3fQ9JIG4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ppp1r3fQ9JIG4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ppp1r3fQ9JIG4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ppp1r3fQ9JIG4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ppp1r3fQ9JIG4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ppp1r3fQ9JIG4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ppp1r3fQ9JIG4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ppp1r3fQ9JIG4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms