Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHI4

Slc13a1, Solute carrier family 13 member 1, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc13a1Q9JHI4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc13a1Q9JHI4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc13a1Q9JHI4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc13a1Q9JHI4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc13a1Q9JHI4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc13a1Q9JHI4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc13a1Q9JHI4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc13a1Q9JHI4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc13a1Q9JHI4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc13a1Q9JHI4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc13a1Q9JHI4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc13a1Q9JHI4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc13a1Q9JHI4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc13a1Q9JHI4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc13a1Q9JHI4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc13a1Q9JHI4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc13a1Q9JHI4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc13a1Q9JHI4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc13a1Q9JHI4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc13a1Q9JHI4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc13a1Q9JHI4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc13a1Q9JHI4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc13a1Q9JHI4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc13a1Q9JHI4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc13a1Q9JHI4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc13a1Q9JHI4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc13a1Q9JHI4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc13a1Q9JHI4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc13a1Q9JHI4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc13a1Q9JHI4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc13a1Q9JHI4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc13a1Q9JHI4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc13a1Q9JHI4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc13a1Q9JHI4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc13a1Q9JHI4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc13a1Q9JHI4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc13a1Q9JHI4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc13a1Q9JHI4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc13a1Q9JHI4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc13a1Q9JHI4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc13a1Q9JHI4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc13a1Q9JHI4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc13a1Q9JHI4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc13a1Q9JHI4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc13a1Q9JHI4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc13a1Q9JHI4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc13a1Q9JHI4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc13a1Q9JHI4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Slc13a1Q9JHI4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Slc13a1Q9JHI4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Slc13a1Q9JHI4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Slc13a1Q9JHI4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Slc13a1Q9JHI4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc13a1Q9JHI4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc13a1Q9JHI4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc13a1Q9JHI4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc13a1Q9JHI4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc13a1Q9JHI4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc13a1Q9JHI4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc13a1Q9JHI4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc13a1Q9JHI4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc13a1Q9JHI4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc13a1Q9JHI4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc13a1Q9JHI4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc13a1Q9JHI4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc13a1Q9JHI4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc13a1Q9JHI4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc13a1Q9JHI4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc13a1Q9JHI4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc13a1Q9JHI4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc13a1Q9JHI4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc13a1Q9JHI4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc13a1Q9JHI4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc13a1Q9JHI4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc13a1Q9JHI4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc13a1Q9JHI4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc13a1Q9JHI4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc13a1Q9JHI4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc13a1Q9JHI4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Slc13a1Q9JHI4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc13a1Q9JHI4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc13a1Q9JHI4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc13a1Q9JHI4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc13a1Q9JHI4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc13a1Q9JHI4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc13a1Q9JHI4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc13a1Q9JHI4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc13a1Q9JHI4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc13a1Q9JHI4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc13a1Q9JHI4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc13a1Q9JHI4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc13a1Q9JHI4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc13a1Q9JHI4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc13a1Q9JHI4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc13a1Q9JHI4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc13a1Q9JHI4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc13a1Q9JHI4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc13a1Q9JHI4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc13a1Q9JHI4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc13a1Q9JHI4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms