Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHB3

Timp4, Metalloproteinase inhibitor 4, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp4Q9JHB3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Timp4Q9JHB3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Timp4Q9JHB3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Timp4Q9JHB3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Timp4Q9JHB3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Timp4Q9JHB3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Timp4Q9JHB3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Timp4Q9JHB3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Timp4Q9JHB3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Timp4Q9JHB3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Timp4Q9JHB3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Timp4Q9JHB3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Timp4Q9JHB3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Timp4Q9JHB3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Timp4Q9JHB3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Timp4Q9JHB3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Timp4Q9JHB3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Timp4Q9JHB3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Timp4Q9JHB3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Timp4Q9JHB3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Timp4Q9JHB3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Timp4Q9JHB3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Timp4Q9JHB3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Timp4Q9JHB3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Timp4Q9JHB3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Timp4Q9JHB3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Timp4Q9JHB3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Timp4Q9JHB3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Timp4Q9JHB3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Timp4Q9JHB3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Timp4Q9JHB3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Timp4Q9JHB3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Timp4Q9JHB3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Timp4Q9JHB3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Timp4Q9JHB3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Timp4Q9JHB3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Timp4Q9JHB3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Timp4Q9JHB3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Timp4Q9JHB3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Timp4Q9JHB3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Timp4Q9JHB3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Timp4Q9JHB3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Timp4Q9JHB3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Timp4Q9JHB3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Timp4Q9JHB3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Timp4Q9JHB3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Timp4Q9JHB3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Timp4Q9JHB3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Timp4Q9JHB3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Timp4Q9JHB3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Timp4Q9JHB3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Timp4Q9JHB3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Timp4Q9JHB3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Timp4Q9JHB3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Timp4Q9JHB3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Timp4Q9JHB3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Timp4Q9JHB3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Timp4Q9JHB3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Timp4Q9JHB3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Timp4Q9JHB3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Timp4Q9JHB3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Timp4Q9JHB3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Timp4Q9JHB3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Timp4Q9JHB3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Timp4Q9JHB3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Timp4Q9JHB3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Timp4Q9JHB3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Timp4Q9JHB3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Timp4Q9JHB3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Timp4Q9JHB3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Timp4Q9JHB3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Timp4Q9JHB3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Timp4Q9JHB3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Timp4Q9JHB3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Timp4Q9JHB3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Timp4Q9JHB3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Timp4Q9JHB3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Timp4Q9JHB3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Timp4Q9JHB3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Timp4Q9JHB3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Timp4Q9JHB3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Timp4Q9JHB3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Timp4Q9JHB3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Timp4Q9JHB3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Timp4Q9JHB3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Timp4Q9JHB3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Timp4Q9JHB3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Timp4Q9JHB3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Timp4Q9JHB3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Timp4Q9JHB3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Timp4Q9JHB3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Timp4Q9JHB3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Timp4Q9JHB3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Timp4Q9JHB3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Timp4Q9JHB3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Timp4Q9JHB3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Timp4Q9JHB3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Timp4Q9JHB3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Timp4Q9JHB3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Timp4Q9JHB3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86 ms