Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESW8

Pgpep1, Pyroglutamyl-peptidase 1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1Q9ESW8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pgpep1Q9ESW8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pgpep1Q9ESW8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pgpep1Q9ESW8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pgpep1Q9ESW8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pgpep1Q9ESW8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pgpep1Q9ESW8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pgpep1Q9ESW8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pgpep1Q9ESW8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pgpep1Q9ESW8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pgpep1Q9ESW8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pgpep1Q9ESW8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pgpep1Q9ESW8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pgpep1Q9ESW8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pgpep1Q9ESW8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pgpep1Q9ESW8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pgpep1Q9ESW8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pgpep1Q9ESW8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pgpep1Q9ESW8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pgpep1Q9ESW8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pgpep1Q9ESW8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pgpep1Q9ESW8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pgpep1Q9ESW8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pgpep1Q9ESW8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pgpep1Q9ESW8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pgpep1Q9ESW8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pgpep1Q9ESW8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pgpep1Q9ESW8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pgpep1Q9ESW8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pgpep1Q9ESW8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pgpep1Q9ESW8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pgpep1Q9ESW8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pgpep1Q9ESW8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pgpep1Q9ESW8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pgpep1Q9ESW8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pgpep1Q9ESW8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pgpep1Q9ESW8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pgpep1Q9ESW8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pgpep1Q9ESW8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pgpep1Q9ESW8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pgpep1Q9ESW8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pgpep1Q9ESW8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pgpep1Q9ESW8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pgpep1Q9ESW8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pgpep1Q9ESW8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pgpep1Q9ESW8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pgpep1Q9ESW8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pgpep1Q9ESW8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pgpep1Q9ESW8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pgpep1Q9ESW8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pgpep1Q9ESW8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pgpep1Q9ESW8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pgpep1Q9ESW8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pgpep1Q9ESW8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pgpep1Q9ESW8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pgpep1Q9ESW8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pgpep1Q9ESW8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pgpep1Q9ESW8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pgpep1Q9ESW8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pgpep1Q9ESW8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pgpep1Q9ESW8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pgpep1Q9ESW8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pgpep1Q9ESW8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pgpep1Q9ESW8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pgpep1Q9ESW8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pgpep1Q9ESW8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pgpep1Q9ESW8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pgpep1Q9ESW8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pgpep1Q9ESW8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pgpep1Q9ESW8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pgpep1Q9ESW8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pgpep1Q9ESW8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pgpep1Q9ESW8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pgpep1Q9ESW8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pgpep1Q9ESW8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pgpep1Q9ESW8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pgpep1Q9ESW8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pgpep1Q9ESW8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pgpep1Q9ESW8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pgpep1Q9ESW8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pgpep1Q9ESW8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pgpep1Q9ESW8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pgpep1Q9ESW8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pgpep1Q9ESW8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pgpep1Q9ESW8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pgpep1Q9ESW8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pgpep1Q9ESW8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pgpep1Q9ESW8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pgpep1Q9ESW8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pgpep1Q9ESW8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pgpep1Q9ESW8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pgpep1Q9ESW8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pgpep1Q9ESW8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pgpep1Q9ESW8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pgpep1Q9ESW8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pgpep1Q9ESW8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pgpep1Q9ESW8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pgpep1Q9ESW8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pgpep1Q9ESW8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pgpep1Q9ESW8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms