Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG2

Ropn1, Ropporin-1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1Q9ESG2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Ropn1Q9ESG2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ropn1Q9ESG2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ropn1Q9ESG2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ropn1Q9ESG2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ropn1Q9ESG2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ropn1Q9ESG2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ropn1Q9ESG2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ropn1Q9ESG2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ropn1Q9ESG2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ropn1Q9ESG2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ropn1Q9ESG2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ropn1Q9ESG2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ropn1Q9ESG2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ropn1Q9ESG2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ropn1Q9ESG2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ropn1Q9ESG2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ropn1Q9ESG2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ropn1Q9ESG2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ropn1Q9ESG2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ropn1Q9ESG2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ropn1Q9ESG2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ropn1Q9ESG2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ropn1Q9ESG2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ropn1Q9ESG2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ropn1Q9ESG2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ropn1Q9ESG2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ropn1Q9ESG2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ropn1Q9ESG2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ropn1Q9ESG2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ropn1Q9ESG2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ropn1Q9ESG2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ropn1Q9ESG2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ropn1Q9ESG2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ropn1Q9ESG2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ropn1Q9ESG2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ropn1Q9ESG2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ropn1Q9ESG2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ropn1Q9ESG2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ropn1Q9ESG2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ropn1Q9ESG2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ropn1Q9ESG2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ropn1Q9ESG2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ropn1Q9ESG2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ropn1Q9ESG2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ropn1Q9ESG2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ropn1Q9ESG2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ropn1Q9ESG2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ropn1Q9ESG2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ropn1Q9ESG2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ropn1Q9ESG2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ropn1Q9ESG2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ropn1Q9ESG2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ropn1Q9ESG2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ropn1Q9ESG2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ropn1Q9ESG2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ropn1Q9ESG2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ropn1Q9ESG2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ropn1Q9ESG2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ropn1Q9ESG2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ropn1Q9ESG2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ropn1Q9ESG2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ropn1Q9ESG2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ropn1Q9ESG2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ropn1Q9ESG2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ropn1Q9ESG2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ropn1Q9ESG2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ropn1Q9ESG2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ropn1Q9ESG2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ropn1Q9ESG2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ropn1Q9ESG2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ropn1Q9ESG2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ropn1Q9ESG2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ropn1Q9ESG2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ropn1Q9ESG2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ropn1Q9ESG2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ropn1Q9ESG2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ropn1Q9ESG2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ropn1Q9ESG2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ropn1Q9ESG2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ropn1Q9ESG2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ropn1Q9ESG2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ropn1Q9ESG2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ropn1Q9ESG2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ropn1Q9ESG2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ropn1Q9ESG2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ropn1Q9ESG2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ropn1Q9ESG2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ropn1Q9ESG2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ropn1Q9ESG2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ropn1Q9ESG2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ropn1Q9ESG2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ropn1Q9ESG2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ropn1Q9ESG2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ropn1Q9ESG2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ropn1Q9ESG2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ropn1Q9ESG2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ropn1Q9ESG2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ropn1Q9ESG2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ropn1Q9ESG2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms