Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQG9

Col4a3bp, Collagen type IV alpha-3-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3bpQ9EQG9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Col4a3bpQ9EQG9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Col4a3bpQ9EQG9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Col4a3bpQ9EQG9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Col4a3bpQ9EQG9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Col4a3bpQ9EQG9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Col4a3bpQ9EQG9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Col4a3bpQ9EQG9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Col4a3bpQ9EQG9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Col4a3bpQ9EQG9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Col4a3bpQ9EQG9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Col4a3bpQ9EQG9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Col4a3bpQ9EQG9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Col4a3bpQ9EQG9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Col4a3bpQ9EQG9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Col4a3bpQ9EQG9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Col4a3bpQ9EQG9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Col4a3bpQ9EQG9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Col4a3bpQ9EQG9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Col4a3bpQ9EQG9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Col4a3bpQ9EQG9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Col4a3bpQ9EQG9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Col4a3bpQ9EQG9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Col4a3bpQ9EQG9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Col4a3bpQ9EQG9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Col4a3bpQ9EQG9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Col4a3bpQ9EQG9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Col4a3bpQ9EQG9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Col4a3bpQ9EQG9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Col4a3bpQ9EQG9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Col4a3bpQ9EQG9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Col4a3bpQ9EQG9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Col4a3bpQ9EQG9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Col4a3bpQ9EQG9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Col4a3bpQ9EQG9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Col4a3bpQ9EQG9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Col4a3bpQ9EQG9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Col4a3bpQ9EQG9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Col4a3bpQ9EQG9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Col4a3bpQ9EQG9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Col4a3bpQ9EQG9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Col4a3bpQ9EQG9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Col4a3bpQ9EQG9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Col4a3bpQ9EQG9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Col4a3bpQ9EQG9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Col4a3bpQ9EQG9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Col4a3bpQ9EQG9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Col4a3bpQ9EQG9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Col4a3bpQ9EQG9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Col4a3bpQ9EQG9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Col4a3bpQ9EQG9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Col4a3bpQ9EQG9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Col4a3bpQ9EQG9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Col4a3bpQ9EQG9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Col4a3bpQ9EQG9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Col4a3bpQ9EQG9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Col4a3bpQ9EQG9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Col4a3bpQ9EQG9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Col4a3bpQ9EQG9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Col4a3bpQ9EQG9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Col4a3bpQ9EQG9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Col4a3bpQ9EQG9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Col4a3bpQ9EQG9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Col4a3bpQ9EQG9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Col4a3bpQ9EQG9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Col4a3bpQ9EQG9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Col4a3bpQ9EQG9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Col4a3bpQ9EQG9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Col4a3bpQ9EQG9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Col4a3bpQ9EQG9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Col4a3bpQ9EQG9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Col4a3bpQ9EQG9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Col4a3bpQ9EQG9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Col4a3bpQ9EQG9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Col4a3bpQ9EQG9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Col4a3bpQ9EQG9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Col4a3bpQ9EQG9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Col4a3bpQ9EQG9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Col4a3bpQ9EQG9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Col4a3bpQ9EQG9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Col4a3bpQ9EQG9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Col4a3bpQ9EQG9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Col4a3bpQ9EQG9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Col4a3bpQ9EQG9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Col4a3bpQ9EQG9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Col4a3bpQ9EQG9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Col4a3bpQ9EQG9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Col4a3bpQ9EQG9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Col4a3bpQ9EQG9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Col4a3bpQ9EQG9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Col4a3bpQ9EQG9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Col4a3bpQ9EQG9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Col4a3bpQ9EQG9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Col4a3bpQ9EQG9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Col4a3bpQ9EQG9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Col4a3bpQ9EQG9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Col4a3bpQ9EQG9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Col4a3bpQ9EQG9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Col4a3bpQ9EQG9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col4a3bpQ9EQG9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms