Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP53

Tsc1, Hamartin, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsc1Q9EP53 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tsc1Q9EP53 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tsc1Q9EP53 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tsc1Q9EP53 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tsc1Q9EP53 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tsc1Q9EP53 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tsc1Q9EP53 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tsc1Q9EP53 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tsc1Q9EP53 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tsc1Q9EP53 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tsc1Q9EP53 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tsc1Q9EP53 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tsc1Q9EP53 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tsc1Q9EP53 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tsc1Q9EP53 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tsc1Q9EP53 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tsc1Q9EP53 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tsc1Q9EP53 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tsc1Q9EP53 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tsc1Q9EP53 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tsc1Q9EP53 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tsc1Q9EP53 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Tsc1Q9EP53 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tsc1Q9EP53 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tsc1Q9EP53 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tsc1Q9EP53 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tsc1Q9EP53 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tsc1Q9EP53 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tsc1Q9EP53 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tsc1Q9EP53 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tsc1Q9EP53 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tsc1Q9EP53 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tsc1Q9EP53 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tsc1Q9EP53 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tsc1Q9EP53 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tsc1Q9EP53 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tsc1Q9EP53 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tsc1Q9EP53 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tsc1Q9EP53 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tsc1Q9EP53 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tsc1Q9EP53 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tsc1Q9EP53 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tsc1Q9EP53 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tsc1Q9EP53 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tsc1Q9EP53 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tsc1Q9EP53 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Tsc1Q9EP53 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tsc1Q9EP53 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tsc1Q9EP53 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tsc1Q9EP53 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tsc1Q9EP53 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tsc1Q9EP53 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tsc1Q9EP53 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tsc1Q9EP53 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tsc1Q9EP53 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tsc1Q9EP53 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tsc1Q9EP53 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tsc1Q9EP53 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tsc1Q9EP53 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tsc1Q9EP53 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tsc1Q9EP53 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tsc1Q9EP53 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tsc1Q9EP53 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tsc1Q9EP53 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tsc1Q9EP53 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tsc1Q9EP53 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tsc1Q9EP53 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tsc1Q9EP53 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tsc1Q9EP53 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tsc1Q9EP53 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tsc1Q9EP53 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Tsc1Q9EP53 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tsc1Q9EP53 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tsc1Q9EP53 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tsc1Q9EP53 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tsc1Q9EP53 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Tsc1Q9EP53 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tsc1Q9EP53 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tsc1Q9EP53 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tsc1Q9EP53 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tsc1Q9EP53 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Tsc1Q9EP53 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tsc1Q9EP53 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tsc1Q9EP53 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tsc1Q9EP53 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tsc1Q9EP53 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tsc1Q9EP53 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tsc1Q9EP53 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Tsc1Q9EP53 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tsc1Q9EP53 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tsc1Q9EP53 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tsc1Q9EP53 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tsc1Q9EP53 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tsc1Q9EP53 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tsc1Q9EP53 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tsc1Q9EP53 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tsc1Q9EP53 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tsc1Q9EP53 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tsc1Q9EP53 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tsc1Q9EP53 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms