Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tspan4Q9DCK3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tspan4Q9DCK3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tspan4Q9DCK3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tspan4Q9DCK3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tspan4Q9DCK3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tspan4Q9DCK3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tspan4Q9DCK3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tspan4Q9DCK3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tspan4Q9DCK3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tspan4Q9DCK3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tspan4Q9DCK3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tspan4Q9DCK3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tspan4Q9DCK3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tspan4Q9DCK3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tspan4Q9DCK3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tspan4Q9DCK3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tspan4Q9DCK3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tspan4Q9DCK3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tspan4Q9DCK3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tspan4Q9DCK3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tspan4Q9DCK3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tspan4Q9DCK3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tspan4Q9DCK3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tspan4Q9DCK3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Tspan4Q9DCK3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tspan4Q9DCK3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tspan4Q9DCK3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tspan4Q9DCK3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tspan4Q9DCK3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tspan4Q9DCK3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tspan4Q9DCK3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tspan4Q9DCK3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tspan4Q9DCK3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tspan4Q9DCK3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tspan4Q9DCK3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tspan4Q9DCK3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tspan4Q9DCK3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tspan4Q9DCK3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Tspan4Q9DCK3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tspan4Q9DCK3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tspan4Q9DCK3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Tspan4Q9DCK3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tspan4Q9DCK3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tspan4Q9DCK3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tspan4Q9DCK3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tspan4Q9DCK3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tspan4Q9DCK3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tspan4Q9DCK3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tspan4Q9DCK3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tspan4Q9DCK3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tspan4Q9DCK3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tspan4Q9DCK3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tspan4Q9DCK3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tspan4Q9DCK3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tspan4Q9DCK3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tspan4Q9DCK3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tspan4Q9DCK3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tspan4Q9DCK3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Tspan4Q9DCK3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tspan4Q9DCK3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Tspan4Q9DCK3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tspan4Q9DCK3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tspan4Q9DCK3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tspan4Q9DCK3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tspan4Q9DCK3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tspan4Q9DCK3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tspan4Q9DCK3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tspan4Q9DCK3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tspan4Q9DCK3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tspan4Q9DCK3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tspan4Q9DCK3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tspan4Q9DCK3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tspan4Q9DCK3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tspan4Q9DCK3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tspan4Q9DCK3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tspan4Q9DCK3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tspan4Q9DCK3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Tspan4Q9DCK3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tspan4Q9DCK3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tspan4Q9DCK3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tspan4Q9DCK3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tspan4Q9DCK3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tspan4Q9DCK3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Tspan4Q9DCK3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tspan4Q9DCK3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tspan4Q9DCK3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tspan4Q9DCK3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tspan4Q9DCK3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tspan4Q9DCK3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tspan4Q9DCK3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tspan4Q9DCK3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tspan4Q9DCK3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tspan4Q9DCK3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tspan4Q9DCK3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tspan4Q9DCK3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tspan4Q9DCK3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tspan4Q9DCK3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tspan4Q9DCK3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tspan4Q9DCK3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 202 ms