Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY1

Syvn1, E3 ubiquitin-protein ligase synoviolin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syvn1Q9DBY1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syvn1Q9DBY1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syvn1Q9DBY1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syvn1Q9DBY1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Syvn1Q9DBY1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syvn1Q9DBY1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syvn1Q9DBY1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syvn1Q9DBY1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Syvn1Q9DBY1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Syvn1Q9DBY1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Syvn1Q9DBY1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Syvn1Q9DBY1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Syvn1Q9DBY1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syvn1Q9DBY1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syvn1Q9DBY1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syvn1Q9DBY1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syvn1Q9DBY1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syvn1Q9DBY1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syvn1Q9DBY1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syvn1Q9DBY1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syvn1Q9DBY1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syvn1Q9DBY1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syvn1Q9DBY1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syvn1Q9DBY1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syvn1Q9DBY1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Syvn1Q9DBY1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syvn1Q9DBY1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syvn1Q9DBY1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syvn1Q9DBY1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syvn1Q9DBY1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syvn1Q9DBY1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syvn1Q9DBY1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syvn1Q9DBY1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syvn1Q9DBY1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syvn1Q9DBY1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syvn1Q9DBY1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syvn1Q9DBY1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syvn1Q9DBY1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syvn1Q9DBY1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Syvn1Q9DBY1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syvn1Q9DBY1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Syvn1Q9DBY1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Syvn1Q9DBY1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Syvn1Q9DBY1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Syvn1Q9DBY1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Syvn1Q9DBY1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Syvn1Q9DBY1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Syvn1Q9DBY1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Syvn1Q9DBY1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syvn1Q9DBY1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syvn1Q9DBY1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syvn1Q9DBY1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syvn1Q9DBY1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syvn1Q9DBY1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syvn1Q9DBY1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syvn1Q9DBY1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syvn1Q9DBY1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syvn1Q9DBY1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syvn1Q9DBY1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syvn1Q9DBY1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Syvn1Q9DBY1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Syvn1Q9DBY1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Syvn1Q9DBY1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Syvn1Q9DBY1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Syvn1Q9DBY1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Syvn1Q9DBY1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Syvn1Q9DBY1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Syvn1Q9DBY1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Syvn1Q9DBY1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Syvn1Q9DBY1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Syvn1Q9DBY1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Syvn1Q9DBY1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Syvn1Q9DBY1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Syvn1Q9DBY1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Syvn1Q9DBY1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Syvn1Q9DBY1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Syvn1Q9DBY1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Syvn1Q9DBY1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Syvn1Q9DBY1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Syvn1Q9DBY1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Syvn1Q9DBY1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Syvn1Q9DBY1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Syvn1Q9DBY1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Syvn1Q9DBY1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Syvn1Q9DBY1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Syvn1Q9DBY1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Syvn1Q9DBY1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syvn1Q9DBY1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syvn1Q9DBY1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syvn1Q9DBY1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syvn1Q9DBY1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syvn1Q9DBY1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syvn1Q9DBY1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syvn1Q9DBY1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Syvn1Q9DBY1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Syvn1Q9DBY1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Syvn1Q9DBY1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Syvn1Q9DBY1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Syvn1Q9DBY1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Syvn1Q9DBY1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms