Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBX3

Susd2, Sushi domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd2Q9DBX3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Susd2Q9DBX3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Susd2Q9DBX3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Susd2Q9DBX3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Susd2Q9DBX3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Susd2Q9DBX3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Susd2Q9DBX3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Susd2Q9DBX3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Susd2Q9DBX3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Susd2Q9DBX3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Susd2Q9DBX3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Susd2Q9DBX3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Susd2Q9DBX3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Susd2Q9DBX3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Susd2Q9DBX3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Susd2Q9DBX3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Susd2Q9DBX3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Susd2Q9DBX3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Susd2Q9DBX3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Susd2Q9DBX3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Susd2Q9DBX3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Susd2Q9DBX3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Susd2Q9DBX3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Susd2Q9DBX3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Susd2Q9DBX3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Susd2Q9DBX3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Susd2Q9DBX3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Susd2Q9DBX3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Susd2Q9DBX3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Susd2Q9DBX3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Susd2Q9DBX3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Susd2Q9DBX3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Susd2Q9DBX3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Susd2Q9DBX3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Susd2Q9DBX3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Susd2Q9DBX3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Susd2Q9DBX3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Susd2Q9DBX3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Susd2Q9DBX3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Susd2Q9DBX3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Susd2Q9DBX3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Susd2Q9DBX3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Susd2Q9DBX3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Susd2Q9DBX3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Susd2Q9DBX3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Susd2Q9DBX3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Susd2Q9DBX3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Susd2Q9DBX3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Susd2Q9DBX3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Susd2Q9DBX3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Susd2Q9DBX3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Susd2Q9DBX3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Susd2Q9DBX3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Susd2Q9DBX3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Susd2Q9DBX3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Susd2Q9DBX3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Susd2Q9DBX3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Susd2Q9DBX3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Susd2Q9DBX3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Susd2Q9DBX3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Susd2Q9DBX3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Susd2Q9DBX3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Susd2Q9DBX3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Susd2Q9DBX3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Susd2Q9DBX3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Susd2Q9DBX3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Susd2Q9DBX3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Susd2Q9DBX3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Susd2Q9DBX3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Susd2Q9DBX3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Susd2Q9DBX3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Susd2Q9DBX3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Susd2Q9DBX3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Susd2Q9DBX3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Susd2Q9DBX3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Susd2Q9DBX3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Susd2Q9DBX3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Susd2Q9DBX3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Susd2Q9DBX3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Susd2Q9DBX3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Susd2Q9DBX3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Susd2Q9DBX3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Susd2Q9DBX3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Susd2Q9DBX3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Susd2Q9DBX3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Susd2Q9DBX3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Susd2Q9DBX3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Susd2Q9DBX3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Susd2Q9DBX3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Susd2Q9DBX3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Susd2Q9DBX3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Susd2Q9DBX3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Susd2Q9DBX3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Susd2Q9DBX3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Susd2Q9DBX3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Susd2Q9DBX3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Susd2Q9DBX3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Susd2Q9DBX3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Susd2Q9DBX3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Susd2Q9DBX3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms