Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc97Q9DBT3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc97Q9DBT3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc97Q9DBT3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc97Q9DBT3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc97Q9DBT3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc97Q9DBT3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc97Q9DBT3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc97Q9DBT3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc97Q9DBT3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc97Q9DBT3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc97Q9DBT3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc97Q9DBT3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc97Q9DBT3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc97Q9DBT3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc97Q9DBT3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc97Q9DBT3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc97Q9DBT3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc97Q9DBT3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc97Q9DBT3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc97Q9DBT3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc97Q9DBT3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc97Q9DBT3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc97Q9DBT3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc97Q9DBT3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc97Q9DBT3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc97Q9DBT3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc97Q9DBT3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc97Q9DBT3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc97Q9DBT3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc97Q9DBT3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc97Q9DBT3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc97Q9DBT3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc97Q9DBT3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc97Q9DBT3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc97Q9DBT3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc97Q9DBT3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc97Q9DBT3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc97Q9DBT3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc97Q9DBT3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc97Q9DBT3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc97Q9DBT3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc97Q9DBT3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc97Q9DBT3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc97Q9DBT3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc97Q9DBT3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc97Q9DBT3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc97Q9DBT3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc97Q9DBT3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc97Q9DBT3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc97Q9DBT3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc97Q9DBT3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc97Q9DBT3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc97Q9DBT3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc97Q9DBT3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc97Q9DBT3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc97Q9DBT3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc97Q9DBT3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc97Q9DBT3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc97Q9DBT3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc97Q9DBT3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc97Q9DBT3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc97Q9DBT3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc97Q9DBT3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc97Q9DBT3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc97Q9DBT3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc97Q9DBT3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc97Q9DBT3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc97Q9DBT3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc97Q9DBT3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc97Q9DBT3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc97Q9DBT3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc97Q9DBT3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc97Q9DBT3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc97Q9DBT3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc97Q9DBT3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc97Q9DBT3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc97Q9DBT3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc97Q9DBT3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc97Q9DBT3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc97Q9DBT3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc97Q9DBT3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc97Q9DBT3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc97Q9DBT3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc97Q9DBT3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccdc97Q9DBT3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc97Q9DBT3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc97Q9DBT3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc97Q9DBT3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc97Q9DBT3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc97Q9DBT3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc97Q9DBT3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc97Q9DBT3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc97Q9DBT3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc97Q9DBT3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc97Q9DBT3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc97Q9DBT3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc97Q9DBT3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc97Q9DBT3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc97Q9DBT3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms