Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fundc1Q9DB70 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fundc1Q9DB70 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fundc1Q9DB70 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fundc1Q9DB70 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fundc1Q9DB70 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fundc1Q9DB70 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Fundc1Q9DB70 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fundc1Q9DB70 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fundc1Q9DB70 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fundc1Q9DB70 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fundc1Q9DB70 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fundc1Q9DB70 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Fundc1Q9DB70 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fundc1Q9DB70 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fundc1Q9DB70 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fundc1Q9DB70 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fundc1Q9DB70 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fundc1Q9DB70 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fundc1Q9DB70 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fundc1Q9DB70 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fundc1Q9DB70 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fundc1Q9DB70 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fundc1Q9DB70 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fundc1Q9DB70 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fundc1Q9DB70 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fundc1Q9DB70 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fundc1Q9DB70 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fundc1Q9DB70 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fundc1Q9DB70 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fundc1Q9DB70 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fundc1Q9DB70 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fundc1Q9DB70 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fundc1Q9DB70 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fundc1Q9DB70 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fundc1Q9DB70 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fundc1Q9DB70 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fundc1Q9DB70 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fundc1Q9DB70 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Fundc1Q9DB70 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fundc1Q9DB70 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fundc1Q9DB70 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Fundc1Q9DB70 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fundc1Q9DB70 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fundc1Q9DB70 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fundc1Q9DB70 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Fundc1Q9DB70 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fundc1Q9DB70 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fundc1Q9DB70 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fundc1Q9DB70 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fundc1Q9DB70 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fundc1Q9DB70 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fundc1Q9DB70 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fundc1Q9DB70 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fundc1Q9DB70 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fundc1Q9DB70 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fundc1Q9DB70 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fundc1Q9DB70 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fundc1Q9DB70 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fundc1Q9DB70 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fundc1Q9DB70 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fundc1Q9DB70 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fundc1Q9DB70 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fundc1Q9DB70 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fundc1Q9DB70 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Fundc1Q9DB70 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fundc1Q9DB70 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fundc1Q9DB70 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fundc1Q9DB70 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Fundc1Q9DB70 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fundc1Q9DB70 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fundc1Q9DB70 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fundc1Q9DB70 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fundc1Q9DB70 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fundc1Q9DB70 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Fundc1Q9DB70 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fundc1Q9DB70 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fundc1Q9DB70 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fundc1Q9DB70 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fundc1Q9DB70 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fundc1Q9DB70 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fundc1Q9DB70 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fundc1Q9DB70 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Fundc1Q9DB70 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fundc1Q9DB70 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fundc1Q9DB70 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fundc1Q9DB70 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fundc1Q9DB70 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fundc1Q9DB70 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fundc1Q9DB70 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Fundc1Q9DB70 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Fundc1Q9DB70 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fundc1Q9DB70 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fundc1Q9DB70 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fundc1Q9DB70 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Fundc1Q9DB70 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fundc1Q9DB70 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fundc1Q9DB70 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fundc1Q9DB70 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fundc1Q9DB70 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms