Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pop5Q9DB28 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pop5Q9DB28 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pop5Q9DB28 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pop5Q9DB28 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pop5Q9DB28 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pop5Q9DB28 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pop5Q9DB28 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pop5Q9DB28 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pop5Q9DB28 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pop5Q9DB28 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pop5Q9DB28 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pop5Q9DB28 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pop5Q9DB28 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pop5Q9DB28 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pop5Q9DB28 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pop5Q9DB28 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pop5Q9DB28 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pop5Q9DB28 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pop5Q9DB28 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pop5Q9DB28 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pop5Q9DB28 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pop5Q9DB28 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pop5Q9DB28 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pop5Q9DB28 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pop5Q9DB28 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pop5Q9DB28 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Pop5Q9DB28 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pop5Q9DB28 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pop5Q9DB28 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pop5Q9DB28 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pop5Q9DB28 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pop5Q9DB28 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Pop5Q9DB28 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pop5Q9DB28 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pop5Q9DB28 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pop5Q9DB28 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pop5Q9DB28 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pop5Q9DB28 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pop5Q9DB28 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pop5Q9DB28 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pop5Q9DB28 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pop5Q9DB28 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pop5Q9DB28 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pop5Q9DB28 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pop5Q9DB28 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pop5Q9DB28 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pop5Q9DB28 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pop5Q9DB28 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pop5Q9DB28 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pop5Q9DB28 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pop5Q9DB28 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pop5Q9DB28 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pop5Q9DB28 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pop5Q9DB28 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pop5Q9DB28 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pop5Q9DB28 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pop5Q9DB28 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pop5Q9DB28 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pop5Q9DB28 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pop5Q9DB28 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pop5Q9DB28 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pop5Q9DB28 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pop5Q9DB28 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Pop5Q9DB28 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pop5Q9DB28 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pop5Q9DB28 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pop5Q9DB28 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pop5Q9DB28 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pop5Q9DB28 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pop5Q9DB28 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Pop5Q9DB28 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pop5Q9DB28 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pop5Q9DB28 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pop5Q9DB28 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pop5Q9DB28 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pop5Q9DB28 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pop5Q9DB28 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pop5Q9DB28 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pop5Q9DB28 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pop5Q9DB28 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Pop5Q9DB28 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pop5Q9DB28 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pop5Q9DB28 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pop5Q9DB28 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pop5Q9DB28 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pop5Q9DB28 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Pop5Q9DB28 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Pop5Q9DB28 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Pop5Q9DB28 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pop5Q9DB28 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pop5Q9DB28 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pop5Q9DB28 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pop5Q9DB28 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Pop5Q9DB28 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pop5Q9DB28 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pop5Q9DB28 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pop5Q9DB28 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pop5Q9DB28 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pop5Q9DB28 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms