Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB24

Tceal6, Transcription elongation factor A (SII)-like 6, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tceal6Q9DB24 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tceal6Q9DB24 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tceal6Q9DB24 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tceal6Q9DB24 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Tceal6Q9DB24 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tceal6Q9DB24 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tceal6Q9DB24 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tceal6Q9DB24 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tceal6Q9DB24 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tceal6Q9DB24 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tceal6Q9DB24 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tceal6Q9DB24 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tceal6Q9DB24 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tceal6Q9DB24 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Tceal6Q9DB24 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tceal6Q9DB24 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tceal6Q9DB24 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tceal6Q9DB24 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tceal6Q9DB24 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tceal6Q9DB24 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tceal6Q9DB24 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tceal6Q9DB24 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tceal6Q9DB24 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tceal6Q9DB24 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tceal6Q9DB24 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tceal6Q9DB24 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tceal6Q9DB24 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tceal6Q9DB24 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tceal6Q9DB24 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tceal6Q9DB24 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tceal6Q9DB24 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tceal6Q9DB24 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tceal6Q9DB24 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Tceal6Q9DB24 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tceal6Q9DB24 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tceal6Q9DB24 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tceal6Q9DB24 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tceal6Q9DB24 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tceal6Q9DB24 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tceal6Q9DB24 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tceal6Q9DB24 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tceal6Q9DB24 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tceal6Q9DB24 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tceal6Q9DB24 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tceal6Q9DB24 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tceal6Q9DB24 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tceal6Q9DB24 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Tceal6Q9DB24 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tceal6Q9DB24 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Tceal6Q9DB24 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tceal6Q9DB24 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tceal6Q9DB24 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tceal6Q9DB24 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tceal6Q9DB24 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tceal6Q9DB24 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tceal6Q9DB24 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tceal6Q9DB24 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tceal6Q9DB24 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tceal6Q9DB24 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tceal6Q9DB24 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tceal6Q9DB24 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tceal6Q9DB24 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tceal6Q9DB24 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tceal6Q9DB24 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tceal6Q9DB24 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tceal6Q9DB24 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tceal6Q9DB24 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tceal6Q9DB24 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tceal6Q9DB24 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tceal6Q9DB24 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tceal6Q9DB24 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tceal6Q9DB24 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tceal6Q9DB24 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tceal6Q9DB24 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tceal6Q9DB24 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tceal6Q9DB24 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tceal6Q9DB24 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tceal6Q9DB24 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tceal6Q9DB24 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tceal6Q9DB24 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Tceal6Q9DB24 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tceal6Q9DB24 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tceal6Q9DB24 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tceal6Q9DB24 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tceal6Q9DB24 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tceal6Q9DB24 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tceal6Q9DB24 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tceal6Q9DB24 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tceal6Q9DB24 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tceal6Q9DB24 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tceal6Q9DB24 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tceal6Q9DB24 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tceal6Q9DB24 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tceal6Q9DB24 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tceal6Q9DB24 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tceal6Q9DB24 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tceal6Q9DB24 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tceal6Q9DB24 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tceal6Q9DB24 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tceal6Q9DB24 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms