Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB20

Atp5o, ATP synthase subunit O, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5oQ9DB20 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp5oQ9DB20 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp5oQ9DB20 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp5oQ9DB20 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp5oQ9DB20 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp5oQ9DB20 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp5oQ9DB20 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp5oQ9DB20 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp5oQ9DB20 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp5oQ9DB20 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp5oQ9DB20 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp5oQ9DB20 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp5oQ9DB20 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp5oQ9DB20 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp5oQ9DB20 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp5oQ9DB20 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp5oQ9DB20 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp5oQ9DB20 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp5oQ9DB20 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp5oQ9DB20 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp5oQ9DB20 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp5oQ9DB20 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp5oQ9DB20 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp5oQ9DB20 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp5oQ9DB20 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp5oQ9DB20 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp5oQ9DB20 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp5oQ9DB20 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp5oQ9DB20 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp5oQ9DB20 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp5oQ9DB20 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp5oQ9DB20 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp5oQ9DB20 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Atp5oQ9DB20 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Atp5oQ9DB20 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp5oQ9DB20 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp5oQ9DB20 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp5oQ9DB20 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp5oQ9DB20 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp5oQ9DB20 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp5oQ9DB20 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp5oQ9DB20 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp5oQ9DB20 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp5oQ9DB20 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp5oQ9DB20 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp5oQ9DB20 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp5oQ9DB20 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp5oQ9DB20 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp5oQ9DB20 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp5oQ9DB20 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp5oQ9DB20 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp5oQ9DB20 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp5oQ9DB20 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp5oQ9DB20 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp5oQ9DB20 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp5oQ9DB20 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp5oQ9DB20 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp5oQ9DB20 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp5oQ9DB20 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp5oQ9DB20 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp5oQ9DB20 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp5oQ9DB20 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp5oQ9DB20 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp5oQ9DB20 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp5oQ9DB20 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp5oQ9DB20 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp5oQ9DB20 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp5oQ9DB20 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atp5oQ9DB20 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atp5oQ9DB20 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atp5oQ9DB20 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp5oQ9DB20 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp5oQ9DB20 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp5oQ9DB20 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp5oQ9DB20 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp5oQ9DB20 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp5oQ9DB20 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp5oQ9DB20 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp5oQ9DB20 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp5oQ9DB20 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp5oQ9DB20 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp5oQ9DB20 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp5oQ9DB20 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp5oQ9DB20 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp5oQ9DB20 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp5oQ9DB20 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp5oQ9DB20 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp5oQ9DB20 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp5oQ9DB20 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp5oQ9DB20 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp5oQ9DB20 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp5oQ9DB20 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp5oQ9DB20 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp5oQ9DB20 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp5oQ9DB20 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Atp5oQ9DB20 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Atp5oQ9DB20 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp5oQ9DB20 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp5oQ9DB20 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp5oQ9DB20 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms