Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW9

Cnn3, Calponin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn3Q9DAW9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cnn3Q9DAW9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cnn3Q9DAW9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnn3Q9DAW9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnn3Q9DAW9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnn3Q9DAW9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnn3Q9DAW9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnn3Q9DAW9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnn3Q9DAW9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnn3Q9DAW9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnn3Q9DAW9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnn3Q9DAW9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnn3Q9DAW9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnn3Q9DAW9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnn3Q9DAW9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnn3Q9DAW9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnn3Q9DAW9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnn3Q9DAW9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnn3Q9DAW9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnn3Q9DAW9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnn3Q9DAW9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnn3Q9DAW9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnn3Q9DAW9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnn3Q9DAW9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnn3Q9DAW9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnn3Q9DAW9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnn3Q9DAW9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnn3Q9DAW9 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cnn3Q9DAW9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cnn3Q9DAW9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cnn3Q9DAW9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cnn3Q9DAW9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cnn3Q9DAW9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cnn3Q9DAW9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cnn3Q9DAW9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cnn3Q9DAW9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cnn3Q9DAW9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Cnn3Q9DAW9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cnn3Q9DAW9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cnn3Q9DAW9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cnn3Q9DAW9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cnn3Q9DAW9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cnn3Q9DAW9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnn3Q9DAW9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnn3Q9DAW9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnn3Q9DAW9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnn3Q9DAW9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnn3Q9DAW9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnn3Q9DAW9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnn3Q9DAW9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnn3Q9DAW9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnn3Q9DAW9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnn3Q9DAW9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnn3Q9DAW9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnn3Q9DAW9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnn3Q9DAW9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnn3Q9DAW9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnn3Q9DAW9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnn3Q9DAW9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnn3Q9DAW9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnn3Q9DAW9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnn3Q9DAW9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnn3Q9DAW9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnn3Q9DAW9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnn3Q9DAW9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnn3Q9DAW9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnn3Q9DAW9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnn3Q9DAW9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnn3Q9DAW9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnn3Q9DAW9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnn3Q9DAW9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnn3Q9DAW9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnn3Q9DAW9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnn3Q9DAW9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnn3Q9DAW9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnn3Q9DAW9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnn3Q9DAW9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cnn3Q9DAW9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cnn3Q9DAW9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnn3Q9DAW9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnn3Q9DAW9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnn3Q9DAW9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnn3Q9DAW9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnn3Q9DAW9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnn3Q9DAW9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnn3Q9DAW9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnn3Q9DAW9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnn3Q9DAW9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnn3Q9DAW9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnn3Q9DAW9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnn3Q9DAW9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnn3Q9DAW9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnn3Q9DAW9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnn3Q9DAW9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnn3Q9DAW9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnn3Q9DAW9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnn3Q9DAW9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnn3Q9DAW9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnn3Q9DAW9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnn3Q9DAW9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms