Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAP0

Lrrc46, Leucine-rich repeat-containing protein 46, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc46Q9DAP0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrrc46Q9DAP0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrrc46Q9DAP0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrrc46Q9DAP0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrrc46Q9DAP0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Lrrc46Q9DAP0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrrc46Q9DAP0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrrc46Q9DAP0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrrc46Q9DAP0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrrc46Q9DAP0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrrc46Q9DAP0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrrc46Q9DAP0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrrc46Q9DAP0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrrc46Q9DAP0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrrc46Q9DAP0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrrc46Q9DAP0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrrc46Q9DAP0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrrc46Q9DAP0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrrc46Q9DAP0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrrc46Q9DAP0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrrc46Q9DAP0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrrc46Q9DAP0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrrc46Q9DAP0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrrc46Q9DAP0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrrc46Q9DAP0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrrc46Q9DAP0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrrc46Q9DAP0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrrc46Q9DAP0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrrc46Q9DAP0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrrc46Q9DAP0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrrc46Q9DAP0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrrc46Q9DAP0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrrc46Q9DAP0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrrc46Q9DAP0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrrc46Q9DAP0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrrc46Q9DAP0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrrc46Q9DAP0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrrc46Q9DAP0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrrc46Q9DAP0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrc46Q9DAP0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrc46Q9DAP0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrc46Q9DAP0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrc46Q9DAP0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrc46Q9DAP0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrc46Q9DAP0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrc46Q9DAP0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrc46Q9DAP0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrc46Q9DAP0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrc46Q9DAP0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrc46Q9DAP0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrc46Q9DAP0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrc46Q9DAP0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrc46Q9DAP0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrc46Q9DAP0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrrc46Q9DAP0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrrc46Q9DAP0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrrc46Q9DAP0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrrc46Q9DAP0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrrc46Q9DAP0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrrc46Q9DAP0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrrc46Q9DAP0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrrc46Q9DAP0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrrc46Q9DAP0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrrc46Q9DAP0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrrc46Q9DAP0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrrc46Q9DAP0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrc46Q9DAP0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrc46Q9DAP0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrc46Q9DAP0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrc46Q9DAP0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrc46Q9DAP0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrc46Q9DAP0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrc46Q9DAP0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrc46Q9DAP0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrc46Q9DAP0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrrc46Q9DAP0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrrc46Q9DAP0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lrrc46Q9DAP0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lrrc46Q9DAP0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lrrc46Q9DAP0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lrrc46Q9DAP0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lrrc46Q9DAP0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lrrc46Q9DAP0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lrrc46Q9DAP0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrc46Q9DAP0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrc46Q9DAP0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrc46Q9DAP0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrc46Q9DAP0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrc46Q9DAP0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrc46Q9DAP0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrc46Q9DAP0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrc46Q9DAP0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrc46Q9DAP0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrc46Q9DAP0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrc46Q9DAP0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrc46Q9DAP0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrc46Q9DAP0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrrc46Q9DAP0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrrc46Q9DAP0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrrc46Q9DAP0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms