Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc89Q9DA73 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc89Q9DA73 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc89Q9DA73 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc89Q9DA73 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc89Q9DA73 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc89Q9DA73 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc89Q9DA73 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc89Q9DA73 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc89Q9DA73 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc89Q9DA73 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc89Q9DA73 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc89Q9DA73 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc89Q9DA73 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc89Q9DA73 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc89Q9DA73 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc89Q9DA73 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc89Q9DA73 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc89Q9DA73 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc89Q9DA73 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc89Q9DA73 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc89Q9DA73 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc89Q9DA73 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc89Q9DA73 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc89Q9DA73 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc89Q9DA73 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc89Q9DA73 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc89Q9DA73 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc89Q9DA73 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc89Q9DA73 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc89Q9DA73 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc89Q9DA73 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc89Q9DA73 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc89Q9DA73 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc89Q9DA73 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc89Q9DA73 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc89Q9DA73 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc89Q9DA73 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc89Q9DA73 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc89Q9DA73 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc89Q9DA73 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc89Q9DA73 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc89Q9DA73 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc89Q9DA73 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc89Q9DA73 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc89Q9DA73 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc89Q9DA73 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc89Q9DA73 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc89Q9DA73 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc89Q9DA73 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccdc89Q9DA73 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc89Q9DA73 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc89Q9DA73 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc89Q9DA73 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc89Q9DA73 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc89Q9DA73 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc89Q9DA73 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc89Q9DA73 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc89Q9DA73 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc89Q9DA73 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc89Q9DA73 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc89Q9DA73 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc89Q9DA73 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc89Q9DA73 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc89Q9DA73 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc89Q9DA73 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc89Q9DA73 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc89Q9DA73 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc89Q9DA73 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc89Q9DA73 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc89Q9DA73 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc89Q9DA73 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc89Q9DA73 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc89Q9DA73 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc89Q9DA73 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc89Q9DA73 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc89Q9DA73 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc89Q9DA73 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc89Q9DA73 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc89Q9DA73 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc89Q9DA73 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc89Q9DA73 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc89Q9DA73 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc89Q9DA73 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc89Q9DA73 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc89Q9DA73 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc89Q9DA73 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc89Q9DA73 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc89Q9DA73 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc89Q9DA73 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc89Q9DA73 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc89Q9DA73 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc89Q9DA73 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc89Q9DA73 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc89Q9DA73 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc89Q9DA73 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc89Q9DA73 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc89Q9DA73 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc89Q9DA73 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc89Q9DA73 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.5 ms