Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smco2Q9DA21 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smco2Q9DA21 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smco2Q9DA21 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smco2Q9DA21 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smco2Q9DA21 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smco2Q9DA21 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smco2Q9DA21 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smco2Q9DA21 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smco2Q9DA21 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smco2Q9DA21 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smco2Q9DA21 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smco2Q9DA21 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smco2Q9DA21 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smco2Q9DA21 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smco2Q9DA21 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smco2Q9DA21 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smco2Q9DA21 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smco2Q9DA21 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smco2Q9DA21 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smco2Q9DA21 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smco2Q9DA21 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smco2Q9DA21 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smco2Q9DA21 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smco2Q9DA21 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smco2Q9DA21 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smco2Q9DA21 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smco2Q9DA21 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smco2Q9DA21 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smco2Q9DA21 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smco2Q9DA21 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smco2Q9DA21 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smco2Q9DA21 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smco2Q9DA21 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smco2Q9DA21 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smco2Q9DA21 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smco2Q9DA21 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smco2Q9DA21 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smco2Q9DA21 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Smco2Q9DA21 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smco2Q9DA21 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Smco2Q9DA21 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smco2Q9DA21 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smco2Q9DA21 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smco2Q9DA21 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smco2Q9DA21 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smco2Q9DA21 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smco2Q9DA21 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smco2Q9DA21 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smco2Q9DA21 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smco2Q9DA21 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smco2Q9DA21 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Smco2Q9DA21 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smco2Q9DA21 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smco2Q9DA21 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smco2Q9DA21 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smco2Q9DA21 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smco2Q9DA21 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smco2Q9DA21 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smco2Q9DA21 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smco2Q9DA21 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Smco2Q9DA21 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Smco2Q9DA21 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Smco2Q9DA21 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Smco2Q9DA21 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Smco2Q9DA21 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Smco2Q9DA21 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Smco2Q9DA21 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Smco2Q9DA21 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smco2Q9DA21 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smco2Q9DA21 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smco2Q9DA21 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smco2Q9DA21 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smco2Q9DA21 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smco2Q9DA21 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smco2Q9DA21 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smco2Q9DA21 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smco2Q9DA21 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smco2Q9DA21 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smco2Q9DA21 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smco2Q9DA21 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smco2Q9DA21 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smco2Q9DA21 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smco2Q9DA21 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smco2Q9DA21 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smco2Q9DA21 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smco2Q9DA21 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Smco2Q9DA21 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Smco2Q9DA21 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Smco2Q9DA21 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Smco2Q9DA21 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Smco2Q9DA21 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Smco2Q9DA21 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smco2Q9DA21 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smco2Q9DA21 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smco2Q9DA21 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smco2Q9DA21 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Smco2Q9DA21 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smco2Q9DA21 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smco2Q9DA21 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms