Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp12Q9D9M2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp12Q9D9M2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp12Q9D9M2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp12Q9D9M2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp12Q9D9M2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp12Q9D9M2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp12Q9D9M2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp12Q9D9M2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp12Q9D9M2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp12Q9D9M2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp12Q9D9M2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp12Q9D9M2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp12Q9D9M2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp12Q9D9M2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp12Q9D9M2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp12Q9D9M2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp12Q9D9M2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp12Q9D9M2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp12Q9D9M2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp12Q9D9M2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp12Q9D9M2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp12Q9D9M2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp12Q9D9M2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp12Q9D9M2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp12Q9D9M2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp12Q9D9M2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp12Q9D9M2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp12Q9D9M2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp12Q9D9M2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Usp12Q9D9M2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp12Q9D9M2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp12Q9D9M2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp12Q9D9M2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp12Q9D9M2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp12Q9D9M2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp12Q9D9M2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp12Q9D9M2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp12Q9D9M2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp12Q9D9M2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp12Q9D9M2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp12Q9D9M2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp12Q9D9M2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp12Q9D9M2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp12Q9D9M2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp12Q9D9M2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp12Q9D9M2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp12Q9D9M2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp12Q9D9M2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp12Q9D9M2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp12Q9D9M2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp12Q9D9M2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp12Q9D9M2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp12Q9D9M2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp12Q9D9M2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp12Q9D9M2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp12Q9D9M2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp12Q9D9M2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp12Q9D9M2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp12Q9D9M2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp12Q9D9M2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp12Q9D9M2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp12Q9D9M2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp12Q9D9M2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp12Q9D9M2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp12Q9D9M2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp12Q9D9M2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp12Q9D9M2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp12Q9D9M2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp12Q9D9M2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp12Q9D9M2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp12Q9D9M2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp12Q9D9M2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp12Q9D9M2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp12Q9D9M2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp12Q9D9M2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Usp12Q9D9M2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Usp12Q9D9M2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp12Q9D9M2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp12Q9D9M2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp12Q9D9M2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp12Q9D9M2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp12Q9D9M2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp12Q9D9M2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp12Q9D9M2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp12Q9D9M2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp12Q9D9M2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp12Q9D9M2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp12Q9D9M2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp12Q9D9M2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp12Q9D9M2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp12Q9D9M2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp12Q9D9M2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp12Q9D9M2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp12Q9D9M2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp12Q9D9M2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp12Q9D9M2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp12Q9D9M2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp12Q9D9M2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp12Q9D9M2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms