Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8D0

Tnfrsf13c, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfrsf13cQ9D8D0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfrsf13cQ9D8D0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfrsf13cQ9D8D0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfrsf13cQ9D8D0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnfrsf13cQ9D8D0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnfrsf13cQ9D8D0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnfrsf13cQ9D8D0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnfrsf13cQ9D8D0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnfrsf13cQ9D8D0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnfrsf13cQ9D8D0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnfrsf13cQ9D8D0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnfrsf13cQ9D8D0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnfrsf13cQ9D8D0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnfrsf13cQ9D8D0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfrsf13cQ9D8D0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfrsf13cQ9D8D0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfrsf13cQ9D8D0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfrsf13cQ9D8D0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfrsf13cQ9D8D0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnfrsf13cQ9D8D0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnfrsf13cQ9D8D0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnfrsf13cQ9D8D0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnfrsf13cQ9D8D0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfrsf13cQ9D8D0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnfrsf13cQ9D8D0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnfrsf13cQ9D8D0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnfrsf13cQ9D8D0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnfrsf13cQ9D8D0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnfrsf13cQ9D8D0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnfrsf13cQ9D8D0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnfrsf13cQ9D8D0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnfrsf13cQ9D8D0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnfrsf13cQ9D8D0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnfrsf13cQ9D8D0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfrsf13cQ9D8D0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms