Protein–RNA interactions for Protein: Q9D883

U2af1, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1Q9D883 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
U2af1Q9D883 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
U2af1Q9D883 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
U2af1Q9D883 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
U2af1Q9D883 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
U2af1Q9D883 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
U2af1Q9D883 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
U2af1Q9D883 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
U2af1Q9D883 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
U2af1Q9D883 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
U2af1Q9D883 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
U2af1Q9D883 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
U2af1Q9D883 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
U2af1Q9D883 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
U2af1Q9D883 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
U2af1Q9D883 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
U2af1Q9D883 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
U2af1Q9D883 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
U2af1Q9D883 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
U2af1Q9D883 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
U2af1Q9D883 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
U2af1Q9D883 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
U2af1Q9D883 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
U2af1Q9D883 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
U2af1Q9D883 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
U2af1Q9D883 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
U2af1Q9D883 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
U2af1Q9D883 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
U2af1Q9D883 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
U2af1Q9D883 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
U2af1Q9D883 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
U2af1Q9D883 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
U2af1Q9D883 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
U2af1Q9D883 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
U2af1Q9D883 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
U2af1Q9D883 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
U2af1Q9D883 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
U2af1Q9D883 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
U2af1Q9D883 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
U2af1Q9D883 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
U2af1Q9D883 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
U2af1Q9D883 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
U2af1Q9D883 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
U2af1Q9D883 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
U2af1Q9D883 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
U2af1Q9D883 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
U2af1Q9D883 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
U2af1Q9D883 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
U2af1Q9D883 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
U2af1Q9D883 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
U2af1Q9D883 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
U2af1Q9D883 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
U2af1Q9D883 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
U2af1Q9D883 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
U2af1Q9D883 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
U2af1Q9D883 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
U2af1Q9D883 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
U2af1Q9D883 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
U2af1Q9D883 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
U2af1Q9D883 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
U2af1Q9D883 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
U2af1Q9D883 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
U2af1Q9D883 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
U2af1Q9D883 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
U2af1Q9D883 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
U2af1Q9D883 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
U2af1Q9D883 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
U2af1Q9D883 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
U2af1Q9D883 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
U2af1Q9D883 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
U2af1Q9D883 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
U2af1Q9D883 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
U2af1Q9D883 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
U2af1Q9D883 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
U2af1Q9D883 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
U2af1Q9D883 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
U2af1Q9D883 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
U2af1Q9D883 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
U2af1Q9D883 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
U2af1Q9D883 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
U2af1Q9D883 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
U2af1Q9D883 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
U2af1Q9D883 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
U2af1Q9D883 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
U2af1Q9D883 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
U2af1Q9D883 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
U2af1Q9D883 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
U2af1Q9D883 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
U2af1Q9D883 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
U2af1Q9D883 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
U2af1Q9D883 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
U2af1Q9D883 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
U2af1Q9D883 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
U2af1Q9D883 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
U2af1Q9D883 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
U2af1Q9D883 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
U2af1Q9D883 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
U2af1Q9D883 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
U2af1Q9D883 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
U2af1Q9D883 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms