Protein–RNA interactions for Protein: Q9D706

Rpap3, RNA polymerase II-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpap3Q9D706 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rpap3Q9D706 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rpap3Q9D706 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rpap3Q9D706 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rpap3Q9D706 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rpap3Q9D706 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rpap3Q9D706 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rpap3Q9D706 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rpap3Q9D706 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rpap3Q9D706 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rpap3Q9D706 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rpap3Q9D706 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rpap3Q9D706 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rpap3Q9D706 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rpap3Q9D706 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rpap3Q9D706 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rpap3Q9D706 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rpap3Q9D706 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rpap3Q9D706 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rpap3Q9D706 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rpap3Q9D706 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rpap3Q9D706 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rpap3Q9D706 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rpap3Q9D706 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rpap3Q9D706 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rpap3Q9D706 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rpap3Q9D706 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rpap3Q9D706 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rpap3Q9D706 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rpap3Q9D706 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rpap3Q9D706 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rpap3Q9D706 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rpap3Q9D706 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rpap3Q9D706 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rpap3Q9D706 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Rpap3Q9D706 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rpap3Q9D706 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rpap3Q9D706 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rpap3Q9D706 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rpap3Q9D706 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rpap3Q9D706 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rpap3Q9D706 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rpap3Q9D706 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rpap3Q9D706 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Rpap3Q9D706 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rpap3Q9D706 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rpap3Q9D706 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rpap3Q9D706 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rpap3Q9D706 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rpap3Q9D706 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rpap3Q9D706 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rpap3Q9D706 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rpap3Q9D706 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rpap3Q9D706 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rpap3Q9D706 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rpap3Q9D706 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rpap3Q9D706 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rpap3Q9D706 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rpap3Q9D706 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Rpap3Q9D706 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Rpap3Q9D706 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rpap3Q9D706 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rpap3Q9D706 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rpap3Q9D706 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Rpap3Q9D706 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rpap3Q9D706 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rpap3Q9D706 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rpap3Q9D706 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rpap3Q9D706 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rpap3Q9D706 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rpap3Q9D706 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rpap3Q9D706 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Rpap3Q9D706 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rpap3Q9D706 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rpap3Q9D706 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rpap3Q9D706 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rpap3Q9D706 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rpap3Q9D706 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rpap3Q9D706 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rpap3Q9D706 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rpap3Q9D706 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rpap3Q9D706 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rpap3Q9D706 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rpap3Q9D706 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rpap3Q9D706 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rpap3Q9D706 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rpap3Q9D706 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rpap3Q9D706 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rpap3Q9D706 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rpap3Q9D706 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rpap3Q9D706 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rpap3Q9D706 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Rpap3Q9D706 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rpap3Q9D706 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rpap3Q9D706 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rpap3Q9D706 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rpap3Q9D706 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Rpap3Q9D706 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rpap3Q9D706 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rpap3Q9D706 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms