Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W6

Slco6d1, MCG6225, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slco6d1Q9D5W6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slco6d1Q9D5W6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slco6d1Q9D5W6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slco6d1Q9D5W6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Slco6d1Q9D5W6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slco6d1Q9D5W6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slco6d1Q9D5W6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slco6d1Q9D5W6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slco6d1Q9D5W6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slco6d1Q9D5W6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slco6d1Q9D5W6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slco6d1Q9D5W6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slco6d1Q9D5W6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slco6d1Q9D5W6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slco6d1Q9D5W6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slco6d1Q9D5W6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slco6d1Q9D5W6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slco6d1Q9D5W6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slco6d1Q9D5W6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slco6d1Q9D5W6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slco6d1Q9D5W6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slco6d1Q9D5W6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Slco6d1Q9D5W6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Slco6d1Q9D5W6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slco6d1Q9D5W6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slco6d1Q9D5W6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slco6d1Q9D5W6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slco6d1Q9D5W6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slco6d1Q9D5W6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slco6d1Q9D5W6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slco6d1Q9D5W6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Slco6d1Q9D5W6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slco6d1Q9D5W6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slco6d1Q9D5W6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slco6d1Q9D5W6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slco6d1Q9D5W6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slco6d1Q9D5W6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slco6d1Q9D5W6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slco6d1Q9D5W6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slco6d1Q9D5W6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slco6d1Q9D5W6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slco6d1Q9D5W6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slco6d1Q9D5W6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slco6d1Q9D5W6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slco6d1Q9D5W6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slco6d1Q9D5W6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slco6d1Q9D5W6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slco6d1Q9D5W6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slco6d1Q9D5W6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slco6d1Q9D5W6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slco6d1Q9D5W6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slco6d1Q9D5W6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slco6d1Q9D5W6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Slco6d1Q9D5W6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slco6d1Q9D5W6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slco6d1Q9D5W6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slco6d1Q9D5W6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slco6d1Q9D5W6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slco6d1Q9D5W6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slco6d1Q9D5W6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Slco6d1Q9D5W6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slco6d1Q9D5W6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slco6d1Q9D5W6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slco6d1Q9D5W6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slco6d1Q9D5W6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slco6d1Q9D5W6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Slco6d1Q9D5W6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slco6d1Q9D5W6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slco6d1Q9D5W6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slco6d1Q9D5W6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slco6d1Q9D5W6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slco6d1Q9D5W6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slco6d1Q9D5W6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slco6d1Q9D5W6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slco6d1Q9D5W6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slco6d1Q9D5W6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slco6d1Q9D5W6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slco6d1Q9D5W6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slco6d1Q9D5W6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slco6d1Q9D5W6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slco6d1Q9D5W6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slco6d1Q9D5W6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slco6d1Q9D5W6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Slco6d1Q9D5W6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Slco6d1Q9D5W6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slco6d1Q9D5W6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slco6d1Q9D5W6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slco6d1Q9D5W6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slco6d1Q9D5W6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slco6d1Q9D5W6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Slco6d1Q9D5W6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slco6d1Q9D5W6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slco6d1Q9D5W6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slco6d1Q9D5W6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slco6d1Q9D5W6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slco6d1Q9D5W6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slco6d1Q9D5W6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slco6d1Q9D5W6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slco6d1Q9D5W6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Slco6d1Q9D5W6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.3 ms