Protein–RNA interactions for Protein: Q9D593

Atp6v1e2, V-type proton ATPase subunit E 2, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v1e2Q9D593 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp6v1e2Q9D593 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp6v1e2Q9D593 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp6v1e2Q9D593 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp6v1e2Q9D593 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp6v1e2Q9D593 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp6v1e2Q9D593 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp6v1e2Q9D593 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp6v1e2Q9D593 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp6v1e2Q9D593 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp6v1e2Q9D593 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp6v1e2Q9D593 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp6v1e2Q9D593 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp6v1e2Q9D593 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp6v1e2Q9D593 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp6v1e2Q9D593 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp6v1e2Q9D593 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp6v1e2Q9D593 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp6v1e2Q9D593 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp6v1e2Q9D593 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp6v1e2Q9D593 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp6v1e2Q9D593 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp6v1e2Q9D593 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp6v1e2Q9D593 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Atp6v1e2Q9D593 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Atp6v1e2Q9D593 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp6v1e2Q9D593 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp6v1e2Q9D593 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp6v1e2Q9D593 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp6v1e2Q9D593 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp6v1e2Q9D593 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp6v1e2Q9D593 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp6v1e2Q9D593 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp6v1e2Q9D593 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp6v1e2Q9D593 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp6v1e2Q9D593 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp6v1e2Q9D593 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp6v1e2Q9D593 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp6v1e2Q9D593 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp6v1e2Q9D593 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp6v1e2Q9D593 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp6v1e2Q9D593 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp6v1e2Q9D593 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp6v1e2Q9D593 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp6v1e2Q9D593 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp6v1e2Q9D593 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp6v1e2Q9D593 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp6v1e2Q9D593 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp6v1e2Q9D593 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp6v1e2Q9D593 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp6v1e2Q9D593 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp6v1e2Q9D593 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp6v1e2Q9D593 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp6v1e2Q9D593 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp6v1e2Q9D593 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp6v1e2Q9D593 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp6v1e2Q9D593 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp6v1e2Q9D593 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp6v1e2Q9D593 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp6v1e2Q9D593 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp6v1e2Q9D593 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp6v1e2Q9D593 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp6v1e2Q9D593 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp6v1e2Q9D593 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp6v1e2Q9D593 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp6v1e2Q9D593 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp6v1e2Q9D593 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp6v1e2Q9D593 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp6v1e2Q9D593 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp6v1e2Q9D593 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp6v1e2Q9D593 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp6v1e2Q9D593 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp6v1e2Q9D593 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp6v1e2Q9D593 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp6v1e2Q9D593 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp6v1e2Q9D593 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp6v1e2Q9D593 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp6v1e2Q9D593 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp6v1e2Q9D593 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp6v1e2Q9D593 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp6v1e2Q9D593 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp6v1e2Q9D593 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp6v1e2Q9D593 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp6v1e2Q9D593 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp6v1e2Q9D593 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp6v1e2Q9D593 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp6v1e2Q9D593 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp6v1e2Q9D593 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp6v1e2Q9D593 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp6v1e2Q9D593 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp6v1e2Q9D593 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp6v1e2Q9D593 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp6v1e2Q9D593 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp6v1e2Q9D593 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp6v1e2Q9D593 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp6v1e2Q9D593 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp6v1e2Q9D593 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp6v1e2Q9D593 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp6v1e2Q9D593 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp6v1e2Q9D593 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms