Protein–RNA interactions for Protein: Q9D572

Ubxn11, UBX domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn11Q9D572 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ubxn11Q9D572 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ubxn11Q9D572 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ubxn11Q9D572 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Ubxn11Q9D572 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ubxn11Q9D572 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ubxn11Q9D572 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ubxn11Q9D572 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ubxn11Q9D572 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Ubxn11Q9D572 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ubxn11Q9D572 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ubxn11Q9D572 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ubxn11Q9D572 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ubxn11Q9D572 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ubxn11Q9D572 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ubxn11Q9D572 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ubxn11Q9D572 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ubxn11Q9D572 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ubxn11Q9D572 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ubxn11Q9D572 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ubxn11Q9D572 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ubxn11Q9D572 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ubxn11Q9D572 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ubxn11Q9D572 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ubxn11Q9D572 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ubxn11Q9D572 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ubxn11Q9D572 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ubxn11Q9D572 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ubxn11Q9D572 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Ubxn11Q9D572 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ubxn11Q9D572 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ubxn11Q9D572 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ubxn11Q9D572 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ubxn11Q9D572 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ubxn11Q9D572 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ubxn11Q9D572 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ubxn11Q9D572 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ubxn11Q9D572 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ubxn11Q9D572 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Ubxn11Q9D572 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ubxn11Q9D572 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ubxn11Q9D572 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ubxn11Q9D572 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ubxn11Q9D572 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ubxn11Q9D572 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ubxn11Q9D572 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Ubxn11Q9D572 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ubxn11Q9D572 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ubxn11Q9D572 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ubxn11Q9D572 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ubxn11Q9D572 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ubxn11Q9D572 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ubxn11Q9D572 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ubxn11Q9D572 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ubxn11Q9D572 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ubxn11Q9D572 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Ubxn11Q9D572 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ubxn11Q9D572 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ubxn11Q9D572 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ubxn11Q9D572 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ubxn11Q9D572 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ubxn11Q9D572 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ubxn11Q9D572 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ubxn11Q9D572 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Ubxn11Q9D572 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ubxn11Q9D572 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ubxn11Q9D572 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ubxn11Q9D572 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ubxn11Q9D572 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ubxn11Q9D572 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Ubxn11Q9D572 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ubxn11Q9D572 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ubxn11Q9D572 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ubxn11Q9D572 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ubxn11Q9D572 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ubxn11Q9D572 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ubxn11Q9D572 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ubxn11Q9D572 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ubxn11Q9D572 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ubxn11Q9D572 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ubxn11Q9D572 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ubxn11Q9D572 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ubxn11Q9D572 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ubxn11Q9D572 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ubxn11Q9D572 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ubxn11Q9D572 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ubxn11Q9D572 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ubxn11Q9D572 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ubxn11Q9D572 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ubxn11Q9D572 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ubxn11Q9D572 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ubxn11Q9D572 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ubxn11Q9D572 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ubxn11Q9D572 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ubxn11Q9D572 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ubxn11Q9D572 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ubxn11Q9D572 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ubxn11Q9D572 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ubxn11Q9D572 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ubxn11Q9D572 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms