Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc7Q9D541 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc7Q9D541 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc7Q9D541 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc7Q9D541 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc7Q9D541 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc7Q9D541 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc7Q9D541 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc7Q9D541 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc7Q9D541 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc7Q9D541 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc7Q9D541 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc7Q9D541 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc7Q9D541 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc7Q9D541 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc7Q9D541 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc7Q9D541 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ccdc7Q9D541 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ccdc7Q9D541 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc7Q9D541 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc7Q9D541 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc7Q9D541 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc7Q9D541 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc7Q9D541 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc7Q9D541 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc7Q9D541 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc7Q9D541 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc7Q9D541 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc7Q9D541 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc7Q9D541 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc7Q9D541 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc7Q9D541 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc7Q9D541 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc7Q9D541 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc7Q9D541 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc7Q9D541 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc7Q9D541 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc7Q9D541 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc7Q9D541 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc7Q9D541 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc7Q9D541 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc7Q9D541 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc7Q9D541 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc7Q9D541 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ccdc7Q9D541 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ccdc7Q9D541 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc7Q9D541 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc7Q9D541 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc7Q9D541 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc7Q9D541 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc7Q9D541 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc7Q9D541 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc7Q9D541 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc7Q9D541 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc7Q9D541 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc7Q9D541 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc7Q9D541 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc7Q9D541 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc7Q9D541 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc7Q9D541 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc7Q9D541 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc7Q9D541 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc7Q9D541 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc7Q9D541 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc7Q9D541 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc7Q9D541 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc7Q9D541 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc7Q9D541 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc7Q9D541 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc7Q9D541 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc7Q9D541 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc7Q9D541 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc7Q9D541 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc7Q9D541 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc7Q9D541 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc7Q9D541 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc7Q9D541 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc7Q9D541 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc7Q9D541 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc7Q9D541 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc7Q9D541 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc7Q9D541 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc7Q9D541 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc7Q9D541 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Ccdc7Q9D541 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc7Q9D541 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc7Q9D541 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc7Q9D541 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc7Q9D541 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc7Q9D541 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc7Q9D541 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc7Q9D541 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc7Q9D541 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc7Q9D541 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc7Q9D541 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc7Q9D541 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc7Q9D541 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc7Q9D541 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc7Q9D541 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc7Q9D541 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms