Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc83Q9D4V3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc83Q9D4V3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc83Q9D4V3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc83Q9D4V3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc83Q9D4V3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc83Q9D4V3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc83Q9D4V3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc83Q9D4V3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc83Q9D4V3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc83Q9D4V3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc83Q9D4V3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc83Q9D4V3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc83Q9D4V3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc83Q9D4V3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc83Q9D4V3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc83Q9D4V3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc83Q9D4V3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc83Q9D4V3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc83Q9D4V3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc83Q9D4V3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Ccdc83Q9D4V3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Ccdc83Q9D4V3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc83Q9D4V3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc83Q9D4V3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc83Q9D4V3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc83Q9D4V3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc83Q9D4V3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc83Q9D4V3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc83Q9D4V3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc83Q9D4V3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc83Q9D4V3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc83Q9D4V3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc83Q9D4V3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc83Q9D4V3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc83Q9D4V3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc83Q9D4V3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc83Q9D4V3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc83Q9D4V3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc83Q9D4V3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc83Q9D4V3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc83Q9D4V3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc83Q9D4V3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc83Q9D4V3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc83Q9D4V3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc83Q9D4V3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc83Q9D4V3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc83Q9D4V3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc83Q9D4V3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc83Q9D4V3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc83Q9D4V3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc83Q9D4V3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc83Q9D4V3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc83Q9D4V3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc83Q9D4V3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc83Q9D4V3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc83Q9D4V3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc83Q9D4V3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc83Q9D4V3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc83Q9D4V3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc83Q9D4V3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc83Q9D4V3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc83Q9D4V3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc83Q9D4V3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc83Q9D4V3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc83Q9D4V3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc83Q9D4V3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc83Q9D4V3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc83Q9D4V3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc83Q9D4V3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc83Q9D4V3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc83Q9D4V3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc83Q9D4V3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc83Q9D4V3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc83Q9D4V3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc83Q9D4V3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc83Q9D4V3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc83Q9D4V3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc83Q9D4V3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc83Q9D4V3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc83Q9D4V3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc83Q9D4V3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc83Q9D4V3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc83Q9D4V3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc83Q9D4V3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc83Q9D4V3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc83Q9D4V3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc83Q9D4V3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc83Q9D4V3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc83Q9D4V3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc83Q9D4V3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc83Q9D4V3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc83Q9D4V3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc83Q9D4V3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc83Q9D4V3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc83Q9D4V3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc83Q9D4V3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc83Q9D4V3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc83Q9D4V3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc83Q9D4V3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms